基于高通量测序454GSFLX的丹参转录组学研究-药学学报.PDFVIP

下载本文档

2
0
约2.16万字
约 6页
2018-03-29 发布于天津
举报
版权申诉

基于高通量测序454GSFLX的丹参转录组学研究-药学学报.PDF

1、有哪些信誉好的足球投注网站（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。。
2、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击这里二次下载。
3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
4、该文档为VIP文档，如果想要下载，成为VIP会员后，下载免费。
5、成为VIP后，下载本文档将扣除1次下载权益。下载后，不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们。
6、成为VIP后，您将拥有八大权益，权益包括：VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
7、VIP文档为合作方或网友上传，每下载1次，网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等，对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档

基于高通量测序454GSFLX的丹参转录组学研究-药学学报

524 药学学报 Acta Pharmaceutica Sinica 2010, 45 (4) : 524529 基于高通量测序454 GS FLX 的丹参转录组学研究 1 1 1 1, 2 1 1* 滢 , 孙超 , 罗红梅 , 李西文 , 牛云云 , 陈士林 ( 1. 中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所, 北京 100193; 2. 清华大学化学系, 北京 100084) 摘要: 本研究应用新一代高通量测序技术454 GS FLX Titanium 对2 年生丹参根的转录组进行测序, 研究其基因表达谱, 挖掘其功能基因。获得46 722 表达序列标签 (express sequence tags, EST), 序列平均长度414 bp, 与 Sanger 测序的长度相当。所得序列与GenBank 丹参EST 合并拼接, 获得18 235 条unigene, 其中, 454 高通量测序发现了 13 980 条新的unigene 。数据库中的序列同源性比较表明, 其中73.0% ( 13 308 条) 与其他生物的已知基因具有不同程度的同源性。通 BLAST 与Gene Ontology 分析获得了可能参与丹参酮合成的序列27 条 (编码 15 个关键酶), 参与丹酚酸合成的序列29 条 (编码 11 个关键酶), 细胞色素P450 序列70 条, 转录因子序列577 条。454 高通量测序技术作为药用植物功能基因组研究的重要手段可在丹参功能基因的发现中发挥重要作用, 这些基因的发现为丹参酮和丹酚酸类化合物生物合成研究奠定了基础, 同时也为丹参的转录组研究提供了基础数据。关键词: 丹参; 454 GS FLX; 表达序列标签; 转录组中图分类号: R931 文献标识码:A 文章编号: 05 13-4870 (2010) 04-0524-06 Transcriptome characterization for Salvia miltiorrhiza using 454 GS FLX 1 1 1 1, 2 1 1* LI Ying , SUN Chao , LUO Hong-mei , LI Xi-wen , NIU Yun-yun , CHEN Shi-lin (1. Institute of Medicinal Plant Develop ment, Chinese Academy of Medical Sciences Peking Union M edical College, Beij ing 100193, China; 2. Depa rtment of Chemistry, Tsinghua University, Beij ing 100084, China) Abstract: To investigate the profile of gene expres