第1章节蛋白质的结构与功能幻灯片.pptVIP

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* (五)超速离心 超速离心法(ultracentrifugation) 不同蛋白质的密度与形态各不相同,在离心力场中沉降的速度也不同,从而将其分离。 既可以用来分离纯化蛋白质也可以用作测定蛋白质的分子量。 *蛋白质在离心场中的行为用沉降系数(sedimentation coefficient, S)表示,沉降系数与蛋白质的密度和形状相关 。 S大体上与蛋白质分子量呈正比关系。 S与蛋白质的密度和形状有关。 如分子量相同,紧密颗粒的摩擦系数小——沉降快;而疏松颗粒的摩擦系数大;——沉降慢。 应用:蛋白质的分离纯化和测分子量。 * 复习题 1、名词解释 肽单元、一、二、三、四级结构 2、蛋白质的基本组成单位是什么?有多少种?按侧链的结构和功能不同,可分为几类?各包括哪些氨基酸? 3、蛋白质的二级结构有几种?各有何特征,由什么化学键维持? * 4、什么是蛋白质变性?变性因素有哪些?变性本质是什么?变形后有什么改变? 5、何为蛋白质的等电点?当pHpI时,蛋白质带何种电荷?当pHpI时,蛋白质带何种电荷? 6、蛋白质分离纯化有几种方法?根据是什么? 7、维持蛋白质三、四级结构的化学键有哪些?哪种最重要? * * 三、多肽链中氨基酸序列分析 1. 分析已纯化蛋白质的氨基酸残基组成 2. 测定多肽链的N端与C端的氨基酸残基 3. 把肽链水解成片段,分别进行分析 4. 测定各肽段的氨基酸排列顺序,一般采用Edman降解法 5. 经过组合排列对比,最终得出完整肽链中氨基酸顺序的结果。 (一)改进的Sanger法 * 水解肽链的方法及特征 裂解剂 裂解位点 胰蛋白酶 Lys、Arg(C) 胰凝乳蛋白酶 Phe、Tyr、Trp(C) 弹性蛋白酶 Ala、Gly、Ser、Val(C) 胃蛋白酶 Phe、Trp、Tyr(N) 溴化氰 Met(C) 羟胺 Asn—Gly * 通过核酸推演的方法 按照三联密码的原则推演出氨基酸的序列 分离编码蛋白质的基因 测定DNA序列 排列出mRNA序列 * 酶:能够起催化作用的蛋白质。 参与物质代谢、细胞生长、分化、代谢调节。 血红蛋白:运输氧和二氧化碳;脂蛋白:血液中运输脂类;清蛋白:血液中可运输多种物质;膜蛋白:负责细胞内外物质的主动运输。 蛋白质存在于生命活动中的所有过程,所以有人说蛋白质是生命的物质基础。 * 1、羧基的解离度大于氨基;2、pHpI,氨基酸带正电荷; pHpI,氨基酸带负电荷。3、等电点时,氨基酸的溶解度最小,容易沉淀;在电场中不移动,正电荷向阴极移动。利用各种氨基酸的等电点不同,可以通过电泳法、离子交换法进行混合氨基酸的分离制备。 * 最后一行链接返回8氨基酸 * 胰岛素51个氨基酸构成(分子量5733) * 有一些肽在生物体内具有特殊功能。激素肽或神经肽都是活性肽,他们广泛分布于整个生物界。作为主要的化学信使,它们在沟通细胞内部、细胞与细胞间以及器官与器官间的信息方面起着重要作用。 * (3)两张纸对角旋转。 * 相邻氨基酸的侧链所带电荷相同,不容易形成α-螺旋。 侧链过大或过小都不容易形成α-螺旋。如Asn、Leu侧链很大,防碍α螺旋的形成。(存在空间位阻); Gly由于没有侧链的约束,其二面角可以任意取值,难以形成α-螺旋 所需的二面角。 * 无规卷曲:毛线团弄乱了之后的状态。还有些规律没找到。 * 还有范德华力。 * 血红素埋在活性部位处。 * 6个结构域,分别结合:肝素蛋白 肌动蛋白等 * 图为三磷酸甘油异构酶 * 各个亚基不能单独起作用。 * 四級構造 的妙用,可以 血紅蛋白 (Hb) 與 肌紅蛋白 (Mb) 的例子說明。 Hb 是四元體,有所謂的四級構造;Mb 為單元體,只有三級構造。Hb 在血中循環,由肺泡中取得氧分子,運送到肌肉中,下載給 Mb。 因此 Hb 必須得知,何時該吸收氧分子,何時該放出;也就是說 Hb 必須有感應氧分子濃度的能力,同時還得做出吸收或放出的動作。這些能力都源自其四級構造的組成。 在靜脈中 Hb 都不載有氧分子,這時候它的四個次體分子都處於一種休息狀態,結合區不容易張開讓 heme 接受氧分子。 當 Hb 循環到肺部時,環境的氧分子濃度提高了,四個次體的任何一個分子接上一個氧分子後,馬上會牽動其它次體,使得其它次體的分子構造舒張,變得很容易接受氧分子。因此在肺部的 Hb 都很容易地滿載氧分子,經動脈輸送至肌肉。若當時肌肉相當勞累,需要大量氧分子的補充,其酸鹼度會降得比較低,Hb 就更容易釋出氧分子,而 Mb 則一昧地吸收 Hb 所下的氧分子,並無調節作用。放下氧分子的 Hb 就回復休息狀態,循著靜脈流回肺部。 蛋白質的構形事實上都不是固定不動,其分子會有某些程度的運動,上述的 Hb 分子也是如此。當其處於休息狀態時,是分子較為緊密的

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