单细胞转录组分析研究进展-生命科学.PDF

第26卷第3期 生命科学 Vol. 26, No. 3 2014年3月 Chinese Bulletin of Life Sciences Mar., 2014 DOI: 10.13376/j .cbls/2014035 文章编号：1004-0374(2014)03-0228-06 本实验室主要围绕哺乳动物早期胚胎发育、研究胚胎干细胞和上胚层 干细胞的自我更新能力和多能性调控的分子机理，特别是表观遗传学调控 机理，以及相关的原始生殖细胞发育过程中的表观遗传学重编程机理。综 合利用单细胞微RNA 表达谱分析技术、单细胞RNA-Seq 转录组高通量测 序技术、单细胞DNA 甲基化组高通量测序技术、单细胞基因组高通量测 序技术，以及染色体免疫共沉淀- 高通量测序技术、小鼠胚胎显微操作技 术等分析方法，系统、全面、深入地分析多能性干细胞的基因动态表达网 络及其表观遗传学调控机理。 文路博士 单细胞转录组分析研究进展 * 文　路 ，汤富酬 (北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心，教育部细胞增殖与分化重点实验室，北京100871) 摘　要：目前常规的转录组分析方法无法揭示单个细胞之间基因表达的异质性，也难以对极少量细胞进行 分析，单细胞转录组分析技术为此提供了有效的研究工具。对单细胞转录组分析技术的历史、发展、策略、 方法和应用进行综述。 关键词：单细胞分析；转录组；异质性；高通量测序 中图分类号：Q786 文献标志码：A Recent progresses in single-cell transcriptome analysis WEN Lu*, TANG Fu-Chou (Ministry of Education Key Laboratory of Cell Proliferation and Differentiation, Biodynamic Optical Imaging Center, College of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, China) Abstract: Standard transcriptome analysis approaches are not able to uncover gene expression heterogeneity among individual cells, nor can they analyze a small number of cells. Single-cell transcriptome analysis approaches provide powerful tools for these purposes. In this review, we discussed the history, recent progresses, strategies, methods and applications of single-cell transcriptome analysis. Key words: single-cell analysis; transcriptome; heterogeneity; high-throughput sequencing 细胞的异质性(heterogeneity) 是一个普遍存在 知是一种具有很强的细胞异质性的疾病，恶性肿瘤 的生物学