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生物信息学课程总结交流报告 数据库检索 报告人： 严盈 PPT制作：08F1B队全体队员 一、相关概念； 二、主要数据库介绍； 三、PubMed 的使用； 四、Entrez 的使用； 五、SRS的使用； 六、总结 一、相关概念 数据库检索：指通过相关的检索系统，对 序列、结构以及各种二次数据库中的注释 信息进行关键词匹配查找。 数据库有哪些信誉好的足球投注网站：指特定的序列相似性比对算 法，找出核酸或蛋白质序列数据库中与检 测序列具有一定程度相似性的序列。 二、主要生物信息数据库简介 1、Genbank 2 、EBI 3、ExPASy 1.Genbank库包含了所有已知的核酸序 列和蛋白质序列，以及与它们相关的 文献著作和生物学注释。它是由美国 国立生物技术信息中心(NCBI)建立和 维护的，其网站为： （1）、NCBI数据库的主要组成部分 NCBI主要部分 中文释义 PubMed 生物医学类文献引文和摘要 PubMed Central 免费的全文期刊文章 Site Search NCBI 网站和FTP站点 Books 在线书库 OMIM 人类孟德尔遗传数据库 OMIA 动物孟德尔遗传数据库 （2 ）、NCBI链接的数据库（共24个） Nucleotide核苷酸序列 CDD PubChem Substance 记录的核心子集 保守的蛋白质域数据库 沉积化学物质记录 EST 3D Domains Protein Clusters 标签序列表达记录 来自Entrez结构的结构域 相关蛋白序列的集合 GSS UniSTS Genome Project 基因组调查序列记录 标记和图谱数据 基因组工程信息 Protein PopSet Probe 序列数据库 种群研究数据集 特殊序列试剂 Genome GEO DataSets GENSAT 全基因组序列 GEO数据的试验系列 小鼠中枢神经系统的基因表达图 Structure Cancer Chromosomes HomoloGene 三维宏观分子结构 细胞生成数据库 真核生物的同源种群 Taxonomy PubChem BioAssay Gene GenBank 中的生物体 化学物质的生物活性筛选 以基因为中心的信息 dbGaP PubChem Compound SNP 基因型和表现型 独特的小分子化学结构 单核苷酸多态性 （3 ）、NCBI工具功能 1）、核酸序列分析 2 ）、蛋白质序列分析 3 ）、蛋白质结构功能分析 4 ）、基因组分析 5 ）、基因表达分析 1）、核酸序列分析工具（共10个） BLAST 基因和蛋白