第3章 基因和基因组1.pptVIP

卫星DNA位于着丝点附近的异染色质区 卫星DNA（satellite DNA）：一些A-T含量很高的简单高度重复序列，由于A-T碱基对浮力密度较低，经CsCl密度梯度离心，会在主要DNA带的上面，伴随着一个次要的DNA带相伴，即所谓的卫星DNA。 Eukaryotic cell 小（微）卫星DNA（minisatellite DNA） 小卫星DNA序列可用于区分不同的个体。 DNA指纹（DNA fingerptinting）原理 也是由短的单位串联重复组成，但总长度短得多，重复单位为6—70bp，称为小卫星或数目可变的串联重复（variable number tandem repeat, VNTR）或短串联重复序列（short tandem repeat,STR） 第三章 基因和基因组 Eukaryotic cell 第一节 染色质和染色体 化学组成 DNA：染色体的主要化学成分,也是遗传信息的载体 蛋白质 组蛋白（histone）：染色体中的碱性蛋白质，其特点是富含二种碱性氨基酸（赖氨酸和精氨酸） Table 非组蛋白（NHP）:染色体中组蛋白以外的蛋白质，是一大类种类繁多的各种蛋白质的总称。 RNA：含量很少,还不到DNA量的10%。 Eukaryotic cell 富Arg 富Arg 　 稍富Lys 稍富Lys 　 极富Lys 类别 10 13 13 15 5 酸性氨基酸％ 102 135 125 129 215 氨基酸残基数 14 11 13 10 6 16 9 11 1 29 碱性氨基酸％Lys　　　Arg H4 H3 H2B H2A H1 组蛋白 11,282 15,342 13,774 13,960 23,000 分子量(dallton) 最保守 最保守 较保守 较保守 不保守 保守性 染色体中的五种组蛋白 back Eukaryotic cell 一、染色质（Chromatin） 染色质是间期细胞核内伸展开的DNA-蛋白质纤维，由核小体为基本单位构成。 H1 1.核小体 1)单个核小体的沉降系数约为11S 用微球菌核酸酶处理染色质可以释放出单个核小体 Eukaryotic cell 2）核小体含有约200bp的DNA，核心组蛋 H2A、H2B、H3、H4各2份拷贝（Core histone）和1份拷贝的组蛋白H1 Eukaryotic cell 4）核小体DNA根据其对微球菌核酸酶的敏感性不同可分为核心DNA（146bp）和连接DNA（8-114bp），核小体DNA长度的变化是由于连接DNA长度的改变。 组蛋白八聚体和146bp的DNA 2.核小体的组装 go 二、染色体 （Chromosome） 染色体是细胞分裂期由染色质高度凝集而形成的一种棒状结构。 DNA 压缩1/7 压缩1/6 压缩1/40 压缩1/5 DNA绕组蛋白 6个核小体围成一圈螺旋 螺线管进一步螺旋化 超螺旋管进一步盘绕和压缩 染色体的多级包装 核小体 螺线管结构 30nm超螺旋管纤维 染色单体 包装比（packing ratio） 算一算经过这几级包装之后，DNA被压缩了多少倍 7×6×40×5=8400 第二节 基因组大小和C-值矛盾 开花植物 鸟类 哺乳动物 爬行动物 两栖类 硬骨鱼 软骨鱼 棘皮动物 甲壳类 昆虫 软体动物 线虫 霉菌 藻类 真菌 革兰氏阳性菌 革兰氏阴性菌 支原体 各物种基因组大小比较 各门类物种的C-值 一个单倍体基因组的DNA含量是恒定的，称为C-值（C-value） 哺乳动物 两栖动物 鸟类 昆虫 线虫 霉菌 酵母 细菌 支原体 各个种类生物的最小基因组与其复杂性正相关 Eukaryotic cell C-值矛盾（C-value paradox）： 基因组大小与机体的遗传复杂性缺乏相关性。 几种常用实验动物的基因组大小 Eukaryotic cell 第三节 原核生物基因组 Eukaryotic cell 1、结构简练。其DNA分子绝大多数用于编码蛋白质，不翻译的序列只占4%； 原核生物基因组特点 2、存在转录单元（为多顺反子mRNA）. 3、基因重叠即同一段DNA片段能够编码两种甚至三种蛋白质分子。 噬菌体Φx174基因图，以A、B、C等标记基因，未标记是调控序列 Φx174 K 参考书30-31页 那么病毒基因组最主要的特点是什么？ 一个是病毒基因组非常“经济”，一个是为多顺反子mRNA 第四节 真核基因组 待测样品复杂长度= 两种复杂性大小不同的DNA序列，当DNA绝对含量（即总核苷酸数）相等时，复杂性小的分子浓度高，复性快。 样品DNA Cot1/2 大肠杆菌DNA Cot1/2 4.2×106 bp× 一、真核生物复性动力学 小分子可以完