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生物化学--第二章 蛋白质化学-蛋白质化学1-2

第一章 蛋白质化学 教学大纲 了解:了解三四级结构,蛋白质的功能和分类;蛋白质的结构及其与功能的关系; 掌握:蛋白质基本的组成单位—氨基酸的分类、结构和性质;掌握蛋白质的一、二级结构,蛋白质的理化性质与分离纯化的方法;蛋白质测序方法 重点、难点:氨基酸的分类、结构和性质;蛋白质的理化性质、加蛋白质测序方法 第一节 蛋白质概述 蛋白质的定义 蛋白质:是一切生物体中普遍存在的,由天然氨基酸通过肽键连接而成的生物大分子;其种类繁多,各具有一定的相对分子质量,复杂的分子结构和特定的生物功能;是表达生物遗传性状的一类主要物质。 一、蛋白质的生物学功能 蛋白质(protein)是生活细胞内含量最丰富、功能最复杂的生物大分子,并参与了几乎所有的生命活动和生命过程。因此,研究蛋白质的结构与功能始终是生命科学最基本的命题。 生物体最主要的特征是生命活动,而蛋白质是生命活动的体现者,具有以下主要功能: 1.催化功能,2.结构功能,3.运输和跨膜转运功能 4.贮存功能,5.运动功能, 6.调节功能,7.保护和防御功能, 8.信息传递与识别功能, 9 特殊功能 蛋白质主要元素组成:C、H、O、N、S 及 P、Fe、Cu、Zn、Mo、I、Se 等微量元素。 蛋白质是生物体内必不可少的重要成分 (结构功能) 蛋白质占干重 人体中(中年人) 人体 45% 水55% 细菌 50%~80% 蛋白质19% 真菌 14%~52% 脂肪19% 酵母菌 14%~50% 糖类<1% 白地菌50% 无机盐7% 第二节:氨基酸 一、氨基酸的结构与分类 二、氨基酸的性质 一、蛋白质的水解 蛋白质完全水解得到各种氨基酸的混合物,部分水解通常得到多肽片段。最后得到各种氨基酸的混合物。所以,氨基酸是蛋白质的基本结构单元。 大多数的蛋白质都是由20种氨基酸组成。这20种氨基酸被称为基本氨基酸。 1.酸水解:(常用 6 mol/L的盐酸或4mol/L的硫酸在105-110℃ 20小时左右) 特点:⑴酸水解不引起氨基酸的消旋缺点:但Trp完全被破坏,Ser和Thr部分破坏,Asn和Gln的酰胺基被水解 2.碱水解 :(一般用5 mol/L氢氧化钠煮沸10-20小时。) 特点:⑴碱水解使氨基酸消旋,许多氨基酸被破坏,⑵但Trp不被破坏。Arg可脱氨生成鸟氨酸及尿素。常用于测定Trp含量 3.酶水解:(目前用于蛋白质肽链断裂的蛋白水解酶称蛋白酶(proteinase)已有十多种) 特点: 酶水解既不破坏氨基酸,也不引起消旋。但酶水解时间长,反应不完全。 (一)基本结构:L-α-氨基酸 α-氨基酸的通式(1) α-氨基酸的通式(2) (二)氨基酸的分类 根据是否构成蛋白质可分为蛋白质AA和非蛋白质AA 1.常见的蛋白质(组成蛋白质)氨基酸有(20种) 2.不常见蛋白质氨基酸 3.非蛋白质氨基酸 A.根据侧链的极性分为2大类 根据侧链的极性分为2大类:1,非极性R基团氨基酸 不带电荷极性R基团氨基酸 带电荷R基团氨基酸 根据侧链的化学结构分为3大类:1脂肪族氨基酸 1.1,中性脂肪族氨基酸 1.3,酸性氨基酸及酰胺 1.4,碱性氨基酸 2, 芳香族氨基酸 3, 杂环氨基酸 二十种常见蛋白质氨基酸的分类、结构及三字符号 二、氨基酸的性质 Trp,Tyr,Phe 的 紫外吸收光谱 中性氨基酸: PI= 氨基酸等电点的计算 1.α-氨基参加的反应 2.α-羧基参加的反应 3. 侧链参加的反应 4.α-氨基与α-羧基共同参加的反应 分离过程: 这些衍生物是无色的,酸性条件下极稳定,可溶于乙酸乙酯,经高压液相即可分析出其N端的氨基酸组成。  酸水解生成的DNS-氨基酸(具有荧光),用乙酸乙酯抽提,可得到DNS-氨基酸,用色谱法分析之,亦可不用分离,直接用纸电泳或薄层层析法鉴定用DNS(二甲基萘磺酰氯)测定N端氨基酸 原理与DNFB法相同,但水解后的DNS氨基酸不需分离,可直接用电泳或层析法鉴定,由于DNS有强烈荧光,灵敏度比DNFB法高100倍,比Edman法高几到十几倍。可用于微量氨基酸的定量,用Edman降解法提供逐次减少一个残基的肽链,灵敏度提高,能连续测定。多肽顺序自动分析仪,样品最低用量可在5pmol。 (6)与荧光胺反应 Tyr的酚基还可以与重氮化合物结合生成桔黄色化合物(Pauly反应)。

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