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Gaussian笔记
Gaussian03运行
1.1Scratch文件
Gaussian运行中使用数个Scratch文件,包括:
CheckPoint文件:name.chk
读写文件:name.rwf
双电子积分文件:name.int
双电子积分的导数文件name.d2e
默认情况下这些文件由Gaussian处理进程ID命名并储存于Scratch中,计算结束后删除。
一般情况下我们希望保存CheckPoint 文件,此时只需要在输入文件中给CheckPoint 文件命名或者指定路径即可。常用格式:%Chk=name;%Chk=chem/scratch/name。
%RWF=path 读写文件
%Int=path 积分文件
%D2E=path 积分导数文件
通过以上三个命令可以将以上三个文件分别存入不同的盘中。
%NoSave命令
%RWF=/chem/scratch2/water 到这里为止的文件都被删除
%NoSave
%Chk=water 到这里为止的文件都被保存
1.2控制内存使用
%mem=***KB/MB/GB/GW
Gaussian03的输入
2.1Gaussian03的输入文件概述
Gaussian03输入文件的基本结构如下
Gaussian03输入界面
Gaussian03的输入部分分类
任务类型
计算方法
基组
输入语法
Gaussian语法规则:
输入是自由格式,而且与大小写无关;
空格、TAB、正斜线/、逗号都可以作为一行之内的不同项之间的连接符。
关键字格式:
keyword = 选项
keyword(选项)
keyword=(选项1, 选项2, ...)
keyword(选项1, 选项2, ...)
这些选项中可以带数值。
在Gaussian中所有的关键字和选项都必须使用可以识别的缩写。引用外部文件使用@文件名。注释行以!开始。
Gaussian03任务类型
形式为方法2/基组2 // 方法1/基组1 的计算执行路径,表示用方法1/基组1进行几何优化计算,之后在优化的结构上用方法2/基组2 进行单点能计算。
预测分子特性
模型化学
如果没有指定关键字,大多数情况下默认为HF。很多关键字的前面可以加“R”,用于闭壳层限制性波函计算;加“U”用于非限制性开壳层波函计算;加“RU”用于限制性开壳层波函计算。
基组
一般计算时需要定义基组,若没有定义,默认使用STO-3G基组。
例外的情况是基组作为该方法的积分部分定义:
所有的半经验方法;所有的分子力学计算方法;混合的模型化学方法,包括Gn,CBS 以及W1 方法。
Gaussian内部存在的基组,其关键字如下:
??STO-3G
??3-21G
??6-21G
??4-31G
??6-31G
??6-31G+:Gaussian 03 还包含George Petersson 等人的6-31G+和6-31G++基组,定义为完全基组方法的一部分。它们可以用关键字6-31G(d)和6-31G(d,p)访问,并可以添加单个或两个弥散函数;还可以添加f-函数:例如,6-31H(df),等。
?? 6-311G:对第一行原子定义6-311G 基组,对第二行原子定义MacLean-Chandler 的(12s,9p)—(621111,52111)基组(注意P,S,和Cl 的基组是被MacLean 和Chandler 称作“负离子”的基组;它们被认为能比中性原子基组给出更好的结果),Ca 和K 是Blaudeau 等人的基组,对第一行过渡元素定义Wachters-Hay全电子基组,并使用Raghavachari 和Trucks的换算因子, 对第三行其它元素使用McGrath,Curtiss 等人的6-311G基组。注意在对第一行过渡元素使用Wachters-Hay 基组时,Raghavachari 和Trucks 推荐使用换算因子并包含弥散函数;包含弥散函数需要使用6-311+G 的形式。MC-311G 等价于6-311G。
??D95V:Dunning/Huzinaga 价电子双zeta 基组。
??D95:Dunning/Huzinaga 全电子双zeta 基组。
??SHC:第一行原子用D95V,第二行原子用Goddard/Smedley ECP。也就是SEC。
?? CEP-4G:Stephens/Basch/Krauss 的ECP 最小基组。
?? CEP-31G:Stephens/Basch/Krauss 的分裂价电子ECP 基组。
?? CEP-121G:Stephens/Basch/Krauss 的三重分裂价电子ECP 基组。
注意超过第二行以后,只有一种CEP 基组,所有三个关键字对这些原子是等价的。
?? LanL2MB:对第一行原子是STO-3G,对Na-Bi 是L
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