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盐藻新基因DsSTPK的克隆及生物信息学分析-大学化学
ISSN 1007 -7626 中国生物化学与分子生物学报 http :/ / cjbmb . bjmu . edu . cn 20 12 3 年 月 CN 11-3870 / Q Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology 28 (3 ):289 ~ 295 · · 研究简报 盐藻新基因DsSTPK 的克隆及生物信息学分析 * , , , , 薛 飞 柴晓杰 余祝君 张晓琳 张 婷 (大连海洋大学 海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室 大连 116023) RT -PCR RACE DsSTPK 1 / 摘要 采用 和 技术克隆了杜氏盐藻 的 种丝氨酸 苏氨酸蛋白激酶基因 (GenBank accession No . JN6252 13), DsS TPK , . , 命名为 并对其进行了生物信息学分析 结果表明 盐 DsSTPK cDNA 3 129 bp , 2 184 bp , 727 . 藻 基因的 全长为 可阅读框为 编码 个氨基酸 该蛋白为亲水 性蛋白, , , , , 无信号肽 无跨膜区域 为非跨膜蛋白 且定位于细胞质基质 二级结构的主要元件为无规 , , 167 ~ 190 1 ATP 、293 ~ 305 1 卷曲和 α 螺旋 三维建模成功 在 位有 个蛋白激酶的 结合区 位 个丝 / , . , 、 氨酸 苏氨酸蛋白激酶活性区 存在多个潜在的磷酸化位点 进一步的进化分析表明 其与衣藻 团 . DsSTPK . 藻亲缘关系最近 这些研究结果为进一步阐明 的功能及作用机制奠定了基础 ; / ; cDNA ; 关键词 杜氏盐藻 丝氨酸 苏氨酸蛋白激酶 全长 生物信息学分析 中图分类号 Q78 Cloning and Bioinformatics Analysis of a Novel Gene DsSTPK from D unaliella salina *
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