水稻二化螟和三化螟基因组ddradseq文库的构建-环境昆虫学报.pdfVIP

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2017-10-18 发布于天津
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水稻二化螟和三化螟基因组ddradseq文库的构建-环境昆虫学报

环境昆虫学报Journal of Environmental Entomology ，November 2016 ，38 (6):1114 － 1120 ISSN 1674-0858 doi :10. 3969 /j. issn. 1674 － 0858. 20 16. 06. 7 水稻二化螟和三化螟基因组ddＲADseq 文库的构建 1* 1，2 * 1 1 1 ＊＊ 1 ＊＊，，，，，杨琼孙娜郑敏罗除成罗光华方继朝 (1. ， 2100 14 ;2. ， 210095) 江苏省农业科学院植物保护研究所南京南京农业大学植物保护学院南京 : “ DNA ” (Double digest restriction －摘要本文介绍了构建水稻二化螟和三化螟双酶切限制性酶切位点关联测序 site associated DNA sequencing ，ddＲADseq) 。 2100 4 2 文库的方法利用安捷伦生物分析仪对种单酶切及种双酶切， MluC I Nla III DNA 的酶切产物片段大小及分布范围进行分析筛选出和两种限制性内切酶组合对螟虫基因组进行。 DNA P1、P2 ， Pippin Prep 285 － 435 bp DNA 。酶切酶切后的片段两端连接上特定的接头后用回收大小为的片段 PCＲ index 。 ddＲADseq 通过扩增进行文库的富集并引入序列构建好的文库用琼脂糖凝胶电泳和生物分析仪进行质。 DNA 、 Illumina 。量检测本方法所构建的文库片段长度分布和摩尔浓度能够达到平台测序的技术要求本研究证 MluC I Nla III ddＲADseq ， ddＲADseq 实了利用和组合酶切构建水稻螟虫基因组文库的可行性为在水稻螟虫中利用