长链非编码RNA的作用机制及其研究方法_夏天.pdfVIP

网络出版时间：2012-12-21 13:33 网络出版地址：/kcms/detail/11.1913.R1333.001.html HEREDITAS (Beijing) 2013 ISSN 0253-9772 长链非编码RNA 的作用机制及其研究方法 夏天，肖丙秀，郭俊明 宁波大学医学院生物化学与分子生物学研究所，浙江省病理生理学技术研究重点实验室，宁波 315211 摘要：长链非编码RNA （Long noncoding RNA ，lncRNA ）通过多种机制发挥其生物学功能，这些机制包 括基因印记、染色质重塑、细胞周期调控、剪接调控、mRNA 降解和翻译调控等。lncRNA 通过这些作用 机制在不同水平进行基因表达调控。在研究 lncRNA 功能的过程中，研究方法的建立和应用起着非常重要 的作用。目前用于lncRNA 研究的主要方法有：微阵列、转录组测序、Northern 印迹、实时荧光定量逆转 录-聚合酶链反应、荧光原位杂交、RNA 干扰和RNA 结合蛋白免疫沉淀等。文章着重介绍了3 种前沿方法， 即：在线快速预测RNA 与蛋白质相互作用的catRAPID、RNA 纯化的染色质分离（Chromatin isolation by RNA purification ，ChIRP ）以及非编码RNA 沉默与定位分析技术（Combined knockdown and localization analysis of noncoding RNAs，c-KLAN ）。 关键词：长链非编码RNA ；作用机制；基因表达调控；研究方法 Acting mechanisms and research methods of long noncoding RNAs XIA Tian, XIAO Bing-Xiu, GUO Jun-Ming Department of Biochemistry and Molecular Biology , Ningbo University School of Medicine , Zhejiang Provincial Key Laboratory of Pathophysiology, Ningbo 315211, China Abstract: Long noncoding RNAs (lncRNAs) play biological roles through a variety of mechanisms, including genetic imprinting, chromatin remodeling, cell cycle control, splicing regulation, mRNA decay, and translational regulation. LncRNAs are involved in the regulation of gene expression through the above mechanisms in different levels. Establishment and application of research technologies are important in understanding of lncRNAs functions. Microarray, RNA sequencing, Northern blot, real time quantitative reverse