拟穴青蟹线粒体coi基因序列克隆及snps位点分析-生物技术通报.pdfVIP

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2017-10-30 发布于天津
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拟穴青蟹线粒体coi基因序列克隆及snps位点分析-生物技术通报.pdf

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拟穴青蟹线粒体coi基因序列克隆及snps位点分析-生物技术通报

生物技术通报 · · BIOTECHNOLOGY B ULLETIN 20 11 7 研究报告年第期拟穴青蟹线粒体 COI 基因序列克隆及 SNPs 位点分析 1，2 1 1 1，2 1 马群群马洪雨马春艳崔海玉马凌波 1 ( ， 200090 ; 中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业资源及生态重点开放实验室上海 2 ， 20 1306) 上海海洋大学水产与生命学院上海 : (Scylla p aramamosain) ， PCR ，摘要根据拟穴青蟹线粒体全序列设计引物采用产物双向测序法克隆了线粒体细胞色 C I (COI) (761 bp)，、 SNPs 。 16 素氧化酶亚基基因部分序列并筛选分析了拟穴青蟹的位点共分析了采自福建省宁德市的只，， GenBank 31 COI ( 425 － 522 bp )。拟穴青蟹另外从数据库中下载了条前人提交的拟穴青蟹基因序列长度在之间利用 MEGA 4. 0 ， T 、C 、A G 37. 6% 、17. 8% 、28. 9% 15. 7% ，G 软件对所有序列进行比对分析结果表明碱基和的平均含量分别为和 + C 33. 5% 。， 761 bp COI 29 SNPs ，的含量平均为分析结果表明在所克隆的的基因序列中共发现个位点其出现频率为 3. 8% 。 29 SNPs ，13 C / T ( 44. 8% )，12 A / G ( 4 1. 4 % )，