草菇基因组中11个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜离子对其表达.PDF

    菌物学报       jwxt@  15 March 2014, 33(2): 323‐333  Http://  Mycosystema ISSN1672‐6472   CN11‐5180/Q © 2014 IMCAS, all rights reserved.    研究论文 Research paper    DOI: 10.13346/j.mycosystema.130231    草菇基因组中11 个漆酶同源基因的生物信息学分析及铜 离子对其表达的影响  1 1, 2 1 1 1* 吴林     朱刚     陈明杰     汪虹     鲍大鹏   1 国家食用菌工程技术研究中心  农业部南方食用菌资源利用重点实验室  上海市农业遗传育种重点开放实验室  上 海市农业科学院食用菌研究所 上海  201403  2 上海海洋大学食品科学与工程学院  上海  201306        摘   要：通过分析草菇基因组中11 个漆酶同源基因所编码的蛋白的性质、转录调控元件和测定铜离子存在条件下 的草菇漆酶活性及11 个漆酶基因的转录水平，揭示了草菇漆酶基因的各自特性、差异以及基因功能与进化机制。 分析表明，这11 个漆酶同源基因编码的蛋白具有508–562aa 个氨基酸，分子量和理论等电点分别为56.25–60.75kDa 和4.51–6.18 （未经翻译后修饰），且都具有真菌漆酶铜离子结合区域的特征序列、4 个能够结合催化底物的环形结 构以及信号肽序列，都属于分泌性的胞外蛋白，但其底物结合位点数目、loop 序列的一致性、跨膜区域数目和位 置以及信号肽位置等存在较大差异。草菇11 个漆酶起始密码子上游2 000bp 的序列中含有真核生物的基本转录调 控元件（TATA‐box，CAAT‐box 及 GC‐box ）和多个潜在的调控元件（MRE、XRE 、STRE、HSE、ARE 、TRE 、NIT 元件 等），但每个基因所含调控元件数目及种类各有不同。在液体培养条件下，铜离子能够诱导除vv‐lac2 、vv‐lac3 和 vv‐lac7 之外的其余8 个草菇漆酶基因的表达，且适宜浓度的铜离子有助于草菇漆酶活性的增加。  关键词：草菇，漆酶基因，铜离子，表达    The bioinformatic analyses and the gene expression induced by Cu2+ of  11 laccase homologous genes from Volvariella volvacea  1 1, 2 1 1 1* WU Lin   ZHU Gang    CHEN Ming‐Jie   WANG Hong    BAO Da‐Peng   1 National Engineering Research Center of Edible Fungi; Key Laboratory of Resources and Utilization of Edible Fungi  (South), Ministry of Agriculture, China; Shanghai Key Laboratory of Agricultural Genetics and Breeding; Institute of Edible  Fungi, Shanghai Academy of Agr