高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的研究进展-中国农学通报.pdfVIP

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高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的研究进展-中国农学通报

中国农学通报 2014,30(15):256-260 Chinese Agricultural Science Bulletin 高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的研究进展 1 2 1 楼 骏 ,柳 勇 ,李 延 1 2 (福建农林大学,福州350002 ;广东省生态环境与土壤研究所,广州510650) 摘 要:为了阐明高通量测序技术在土壤微生物多样性研究中的应用前景,归纳介绍了Solexa、454 和 Ion Torrent 等常用高通量测序技术的原理和优点,综述了近年高通量测序技术在土壤微生物物种多样 性、结构多样性、功能多样性和遗传多样性四个方面应用的研究进展,总结了高通量测序技术应用中存 在的问题,并分析展望了其在土壤微生物多样性研究中的发展趋势。 关键词:高通量测序;土壤微生物;微生物多样性;应用。 中图分类号:Q31 文献标志码:A 论文编号:2013-2513 ReviewofHigh-throughputSequencingTechniquesinStudiesofSoilMicrobialDiversity LouJun,LiuYong,LiYan1 2 1 1 (FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou350002; 2GuangdongInstituteofEco-environmentandSoilSciences,Guangzhou510650) Abstract: Inordertoilluminatetheapplicationprospectsofhigh-throughputsequencingtechniquesinsoil microbialdiversity,thisarticlegaveasummarizationandintroductionofprinciplesandadvantagesofcommon high-throughputsequencingtechniques,includingSolexa, 454 andIonTorrent.Thelatestresearchadvances ofhigh-throughputsequencingtechniquesapplicationswerereviewedinsoilmicrobialspeciesdiversity, structures diversity, functions diversity and genes diversity. Finally, the application problems and the development tendency of high-throughput sequencing techniques used in soil microbial studies were summarizedanddiscussed. Keywords:high-throughputsequencing;soilmicrobiology;microbialdiversity;application. 0 引言 DNA 指纹图谱技术、磷脂脂肪酸分析法等,以及研究 据估计,全球土壤中微生物的种类可达数万种,而

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