基于转录组高通量测序分析白光对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响.pdfVIP

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2017-09-04 发布于天津
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基于转录组高通量测序分析白光对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响

39 6 ( ) Vol． 39 No． 6 第卷第期江西师范大学学报自然科学版 20 15 11 Journal of Jiangxi Normal University (Natural Science) Nov． 20 15 年月文章编号:1000-5862 (20 15)06-0570-05 基于转录组高通量测序分析白光对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响 1 2 1 1 1 1 张俊娥，，，，，邓华锋郑文强江京金聪赵夫凯 (1．，， 330022) 江西师范大学生命科学学院江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室江西南昌 2 ．， 330022) 江西师范大学计算机信息工程学院江西南昌摘要: Illumina HiSeqTM 2500 ，利用平台对光暗培养的杜仲愈伤组织进行了转录组高通量测序利用 BLAST ， ( 12 000 lux ，16 h ，8 h ) 软件进行差异表达基因的功能注释和富集分析就白光光强为光照黑暗． : Trinity 62 030 对杜仲愈伤组织中绿原酸含量的影响进行了研究结果表明通过软件合并组装后共获得 Unigenes ， BLASTX ， 25 4 17 (40 ． 98% ) Unigenes． KEGG 个通过比对共获得个有注释信息的通过对通路进， ( 12 000 lux ，16 h ，8 h ) 18 d ，行深入分析表明白光光强为光照黑暗培养杜仲愈伤组织与绿原酸合成相 3 ， (EC 4 ． 3． 1． 24 ，phenylalanine ammonia-lyase ，关的种酶基因上调表达它们分别为苯丙氨酸解氨酶 PAL)、 -4- (EC 1． 14 ． 13． 11，trans-cinnamate 4-monooxygenase ，C4H)、肉桂酸羟基化酶奎宁酸羟基肉桂酰转 (EC 2 ． 3． 1． 133 ，Shikimate o-hydroxyl-cinnamoyltransferase ，HCT)．，移酶由此推断白光能促进杜仲愈伤组织．