应用dgge分析秸秆日粮对奶牛瘤胃细菌群落的影响-中国农业科学.pdfVIP

中国农业科学 2013,46(5):1025-1035 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2013.05.018 应用DGGE 分析秸秆日粮对奶牛瘤胃细菌群落的影响 金 迪，王加启，卜登攀，赵圣国，胡小丽，赵静雯，卢玉飞，王丹丹，孙 鹏 （中国农业科学院北京畜牧兽医研究所/动物营养学国家重点实验室，北京 100193） 摘要：【目的】通过与苜蓿日粮比较，揭示秸秆日粮模式下瘤胃固液相细菌群落的独特结构。【方法】选择12 头健康且体重相似的装有永久瘤胃瘘管的中国荷斯坦奶牛，分别饲喂以玉米秸秆（CS）和苜蓿、羊草、青贮玉米 三者混合物（MF）为粗饲料组成的日粮，正饲期第13 周连续3 d 分12 个时间点采集瘤胃固、液相内容物样品。 提取微生物DNA 后，利用PCR 结合变性梯度凝胶电泳技术（DGGE）分析细菌群落结构，并进行聚类分析及差异条 带的测序分析。【结果】与MF 组相比，CS 组奶牛瘤胃固、液相细菌DGGE 图谱条带的数目和光密度均有一定差异， 两处理组都各有一些稍显优势的条带，CS 组优势条带要少于MF 组。与MF 组相比，CS 组液相细菌的香浓多样性指 数无差异（P＞0.05），固相细菌香浓多样性指数显著降低（P＜0.01）；通过对差异条带进行测序，发现与MF 组相 比，CS 组中瘤胃细菌Prevotella sp.、Acetivibrio ethanolgignens 和Clostridium sp.减少，并且大量来源于 Bacteroidetes、Firmicutes、Tenericutes 和Proteobacteria 等菌门的未培养细菌有所变化。【结论】秸秆日粮 条件下奶牛瘤胃存在独特的细菌群落结构，细菌多样性较低。 关键词：秸秆; 粗饲料类型; 瘤胃; 细菌群落; DGGE Effect of Corn Straw Diet on Diversity of the Bacterial Community in the Rumen of Dairy Cows Analyzed by DGGE JIN Di, WANG Jia-qi, BU Deng-pan, ZHAO Sheng-guo, HU Xiao-li, ZHAO Jing-wen, LU Yu-fei, WANG Dan-dan, SUN Peng （Institute of Animal Science, Chinese Academy of Agricultural Sciences/State Key Laboratory of Animal Nutrition, Beijing 100193 ） Abstract: 【Objective 】The purpose of this study is to reveal the unique rumen bacterial community under the diet of the corn straw compared to the diet of alfalfa fed to dairy cows. 【Method 】Twelve healthy Chinese Holstein dairy cows with permanent rumen cannula and similar live weight were assigned to two treatments, corn straw diet (CS) and mixed forage (alfalfa, Chinese wildrye hay and silage maize) diet (MF). The solid and liquid fractions of rumen digesta were collected for the successive three days on the 13th week of the experiment. Total DNA was