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云南花生丛枝植原体16srrna和核糖体蛋白基因序列-植物病理学报
植物病理学报 ＡＣＴＡ ＰＨＹＴＯＰＡＴＨＯＬＯＧＩＣＡ ＳＩＮＩＣＡ ４４(４):３７０￣３７８(２０１４) ｄｏｉ:１０.１３９２６/ｊ.ｃｎｋｉ.ａｐｐｓ.２０１４.０４.００５ 云南花生丛枝植原体 １６Ｓ ｒＲＮＡ和核糖体 蛋白基因序列分析 １ ２ １ꎬ３ １∗ １ 万琼莲 ꎬ杨子祥 ꎬ王连春 ꎬ蔡 红 ꎬ陈海如 １ ２ ( 云南农业大学植物病理重点实验室ꎬ昆明６５０２０１ꎻ 云南省农业科学院热区生态农业研究所ꎬ元谋 ６５１３００ꎻ ３玉溪师范学院资源环境学院ꎬ玉溪６５３１００) 摘要:利用植原体１６ＳｒＲＮＡ基因及核糖体蛋白基因(ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎꎬｒｐ)通用引物对发生在云南元谋的花生丛枝病病株 ＤＮＡ进行ＰＣＲ扩增ꎬ并对扩增片段进行序列测定ꎮ 扩增获得的云南元谋花生丛枝植原体(ＰｎＷＢ￣ＹＮｙｍ)１６Ｓ ｒＤＮＡ、１６Ｓ￣ ２３ＳｒＤＮＡ和２３ＳＤＮＡ片段总长１８０６ ｂｐꎬｒｐ基因扩增片段长１ １７１ｂｐꎮ 云南株系与来源于台湾和海南的花生丛枝植原体 均有较高同源性ꎮ 比较１６ＳｒＤＮＡ片段ꎬ发现云南株系在５个位点上与来自台湾或海南的株系存在碱基差异ꎬ其中有 １个 位点的差异是云南元谋株系特异的ꎻ再分别比较核糖体蛋白ｒｐｌＶ￣ｒｐｓＣ ２个基因所编码的氨基酸序列ꎬ发现云南株系ｒｐｓＣ 编码的第１９４位氨基酸与台湾和海南的株系存在差异ꎮ 经１６ＳｒＤＮＡ片段系统进化及ｉＰｈｙＣｌａｓｓｉｆｉｅｒ在线分析ꎬ表明ＰｎＷＢ￣ ＹＮｙｍ在分类上属于１６ＳｒＩＩ￣Ａ亚组成员ꎬ与候选种‘Ｃａｎｄｉｄａｔｕｓ Ｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａ ａｕｓｔｒａｌａｓｉａｅ’相关ꎻ基于ｒｐ基因构建的系统进化 树表明ꎬＰｎＷＢ￣ＹＮｙｍ与１６ＳｒＩＩ￣Ａ亚组各成员聚为同一亚进化支(ｉｉｉ)ꎮ 关键词:云南元谋花生丛枝ꎻ植原体ꎻ１６ＳｒＤＮＡꎻ核糖体蛋白基因ꎻ序列分析 Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ １６Ｓ ｒＲＮＡ ａｎｄ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｇｅｎｅ ｏｆ ｐｅａｎｕｔ ｗｉｔｃｈｅｓ’￣ ｂｒｏｏｍ ｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａ ｄｉｓｅａｓｅ ｉｎ Ｙｕｎｎａｎ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ １ ２ ＷＡＮ Ｑｉｏｎｇ￣ｌｉａｎ ꎬＹＡＮＧ Ｚｉ￣ｘｉａｎｇ ꎬ １ꎬ３ １ １ １ ＷＡＮＧ Ｌｉａｎ￣ｃｈｕｎ ꎬＣＡＩ Ｈｏｎｇ ꎬＣＨＥＮ Ｈａｉ￣ｒｕ ( Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｆｏｒ Ｐｌａｎｔ Ｐａｔｈｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｙｕｎｎａｎ ＰｒｏｖｉｎｃｅꎬＹｕｎｎａｎ ２ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＫｕｎｍｉｎｇ６５０２０１ꎬＣｈｉｎａꎻ ＩｎｓｉｔｉｔｕｔｅｏｆＴｒｏｐｉｃａｌＥｃｏ￣ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ＳｃｉｅｎｃｅｓｏｆＹｕｎｎａｎＡｃａｄｅｍｙｏｆＡｇｒｉｃｕｌ￣ ３ ｔｕｒａｌ ＳｃｉｅｎｃｅｓꎬＹｕａｎｍｏｕ ６５１３００ꎬＣｈｉｎａꎻ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ ＲｅｓｏｕｒｃｅｓａｎｄＥｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔꎬＹｕｘｉ Ｎｏｒｍａｌ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＹｕｘｉ ６５３１００ꎬＣｈｉｎａ) Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｕｓｉｎｇ ＰＣＲ ｗｉｔｈ ｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａ ｕｎｉｖｅｒｓａｌ ｐｒｉｍｅｒ ｐａｉｒ ｆｏｒ １６Ｓ ｒＲＮＡ ａｎｄ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｇｅｎｅ (ｒｐ) ｗａｓｕｓｅｄｔｏｄｅｔｅｃｔｐｈｙｔｏｐｌａｓｍａａｓｓｏｃｉａｔｅｄｗｉｔｈｐｅａｎｕｔｗｉｔｃｈｅｓ’￣ｂ
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