上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台.PDFVIP

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上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台.PDF

上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台介绍 上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms ,SNPs ),指由于单个核苷 酸碱基的改变而导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位 点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就 是SNP 。 由于 SNP 在人类基因组中数量较多,发生频率较高,因此被认为是继微卫 星之后的新一代遗传学标记,在医学遗传学、药物遗传学、疾病遗传学、疾病诊 断学、以及人类进化等研究领域都有着很高的研究价值和应用前景。 目前主要应用领域 ◆复杂疾病的易感性基因分析与基因定位 ◆环境因子易感基因的检出与病原体基因分析 ◆药物开发与个体用药 ◆个体识别与法医鉴定 ◆系统发育分析与病理分子遗传机理的阐明 ◆生物进化与遗传分析 SNP 分型检测服务是上海捷瑞生物工程有限公司于 2007 年推出的服务项 目,它是继本公司完善的全基因合成服务、引物合成服务、测序服务等服务体系 后的又一力作。 基于过硬的引物合成及标记技术、多重 PCR 技术、测序技术, 本公司推出多套 SNP 基因分型检测服务体系,以便于客户选择更适当的服务。 捷瑞生物公司SNP 基因分型技术平台: 1、直接测序SNP 分型技术 2、连接酶检测反应(PCR-LDR)分型技术. 3、多重SNaPshot SNP 分型技术 4 、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MassArray)分型方法 1 上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台介绍 我们拥有四个SNP 基因分型服务平台,我们会根据您的实验要求和实验目 的,样品数和位点数的不同,推荐最合适的基因分型方法。 一、直接测序SNP 分型技术: 原理:通过直接测序的方法来确定位点的基因型,适用于对关键区域SNP 位点的筛选和未知SNP 位点发现,直接测序是SNP 分型的“金标准”,但费用大。 如果需要检测的几个SNP 位点正好位于一个测序单元内(长度小于600bp ),则 单个位点的分型费用可显著降低。对于准确性要求特别高或样本量特别小(几个 或几十个)的项目,这种分型技术很适合。 方法特点: 1)分型最为准确,是SNP 分型“金标准”,是其它分型方法结果的最终验证手 段; 2 )操作过程复杂,分型费用高; 适宜范围: 1)需要检测的几个SNP 位点正好位于一个测序单元内(长度小于600bp )的分 型项目; 2 )对于准确性要求特别高或样本量特别小(几个或几十个)的分型项目,如对 其它SNP 分型方法准确性的验证。 二、连接酶检测反应(LDR)分型方法: 原理:主要应用连接酶检测反应 (ligase detection reaction,LDR)技术。即在 Taq DNA 连接酶的作用下, 当左右两条寡核苷酸探针与目的DNA 序列完全互补, 并且两条探针之间没有空隙时才能发生连接反应,否则连接反应不能进行,最后 通过荧光扫描片段长度,根据测序峰移动的胶位置,通过末端未标记探针的3 个碱基差异,确定同一位点的不同基因型,再通过末端未标记探针的7 个碱基差 异,确定不同位点,最终实现对SNP 位点的精确检测。 2 上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台介绍 PCR-LDR 技术流程: 1、多重PCR 扩增:获得目标位点所在的片断; 2、多重LDR:得到长度各异的检测产物; 3、3730 测序仪检测:根据测序电泳得到不同的峰值; 4 、判断SNPs 结果,数据分析; 3 上海捷瑞生物公司SNP 基因分型服务平台介绍 方法特点: 1. 通用性强:适用于任何多态性位点和各种 SNP 位点的分型,不需要人工引入 酶切位点; 2. 分型准确,检出率高:其准确度可达99.2% 以

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