三角帆蚌HcTyr基因内壳色性状相关SNP筛选及图谱定位.PDFVIP

第41 卷 第 7 期 水 产 学 报 Vol. 41, No. 7 2017 年 7 月 JOURNAL OF FISHERIES OF CHINA July, 2017 文章编号: 1000-0615(2017)07-1044-10 DOI: 10.11964/jfc.20170210717 三角帆蚌HcTyr基因内壳色性状相关SNP筛选及图谱定位 1 1 1,2 1 1,2* 韩学凯 ， 陈夏君， 白志毅 ， 刘晓军 ， 李家乐 (1. 上海海洋大学农业部淡水水产种质资源重点实验室，上海 201306; 2. 上海海洋大学上海市水产养殖工程技术研究中心，上海 201306) 摘要：为研究三角帆蚌HcTyr 基因与内壳色性状的相关性，本实验根据已分离的三角帆 蚌HcTyr 基因进行引物设计和片段扩增，并用144只三角帆蚌对其多态性进行筛选和验 证，卡方检验分析了SNP位点和三角帆蚌内壳色相关性，并对HcTyr 基因进行了图谱定 位。结果显示，在HcTyr 基因上筛选出8个SNP位点，其中有7个SNP位点与三角帆蚌内壳 色L 、a及dE 呈显著相关性，用这7个SNP位点做单倍型构建和分析，发现Ⅱ、Ⅲ及Ⅳ这 3种单倍型在白色群体中出现的频率极显著高于在紫色群体中出现的频率，而Ⅴ和Ⅶ这 2 两种单倍型在紫色群体中出现的频率极显著高于白色群体。进一步在商业养殖群体中 验证发现，Ⅳ和Ⅶ这2 种单倍型可分别作为白色和紫色群体的优势单倍型。研究表明， 三角帆蚌HcTyr 基因可作为内壳色相关的候选基因，其部分SNP位点可用于三角帆蚌分 子辅助育种。另外本实验还将HcTyr 基因定位在三角帆蚌LG16连锁群上，这为进一步解 析该基因调控珍珠颜色形成的分子机制奠定了基础。 关键词: 三角帆蚌；HcTyr ；内壳色；相关性；基因定位 中图分类号: Q 785 ；S 968.3 文献标志码: A [7] 三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)隶属于软体动 子生物学和数量遗传学手段 ，筛选与内壳色相 物门( M o l l u s c a ) ，双壳纲( B i v a l v i a ) ，蚌目 关的分子标记开展三角帆蚌辅助选育工作，将 (Unionida) ，蚌科(Unionidae) ，是我国最具经济价 有可能大大提高育种效率。 值的特有淡水珍珠贝。据报道，世界上约95%的 酪氨酸酶(TYR)是广泛分布于动植物和微生 [8] 淡水珍珠产自中国，而其中70%是由三角帆蚌生 物中含铜离子的金属酶 。研究发现，TYR在色 [1] 产的 。然而，如今