鹿科动物线粒体dna 序列差异和系统进化关系 - 吉林农业大学学报.pdfVIP

吉林农业大学学报　 ２０１７，３９（１）：９４～９９ ｈｔｔｐ：／ ／ ｘｕｅｂａｏ．ｊｌａｕ．ｅｄｕ．ｃｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ ＪｉｌｉｎＡｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｅ⁃ｍａｉｌ：ｊｌｎｄｘｂ＠ｖｉｐ．ｓｉｎａ．ｃｏｍ 鹿科动物线粒体 ＤＮＡ 序列差异和系统进化 关系∗ 鞠　 妍，刘华淼，邢秀梅∗∗ 中国农业科学院特产研究所，特种经济动物分子生物学省部共建国家重点实验室， 长春 １３０１１２ 摘　 要：从ＧｅｎＢａｎｋ数据库中获得２０种鹿科动物的线粒体ＤＮＡ序列全长，分析了序列碱基含量和遗传距离 关系，并构建系统进化树，探讨了鹿科动物的系统进化关系。 序列分析表明：鹿科动物线粒体 ＤＮＡ 全长为 ＋ １６ ３０５～１６４８２ｂｐ，Ａ Ｔ含量约占６２５８％，各物种间遗传距离为００１４～０１６４。 系统进化分析表明：驼鹿在鹿 科动物中可能是最古老的；麋鹿与鹿属亲缘关系较近，支持将麋鹿划到鹿属的观点；泽鹿与花鹿属的斑鹿和豚 鹿先聚到一起，支持将泽鹿划到花鹿属中；麂亚科中小麂可能是最原始的，赤麂和黑麂亲缘关系较近；獐与狍 亲缘关系更近，建议将獐与狍划归到一个亚科。 关键词：鹿科动物；线粒体ＤＮＡ；系统进化；序列分析 中图分类号：Ｓ８２５　 　 　 文献标识码：Ａ　 　 　 文章编号：１０００⁃５６８４（２０１７）０１⁃００９４⁃０６ ＤＯＩ：１０．１３３２７／ ｊ．ｊｊｌａｕ．２０１６．２９７３ 引文格式：鞠妍，刘华淼，邢秀梅．鹿科动物线粒体ＤＮＡ 序列差异和系统进化关系［Ｊ］．吉林农业大学学报， ２０１７，３９（１）：９４⁃９９． Ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ｄｉｖｅｒｇｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｈｙｌｅｔｉｃ Ｅｖｏｌｕｔｉｏｎ ｏｆ Ｄｅｅｒ （Ｃｅｒｖｉｄａｅ） ｍｔＤＮＡ ＪＵＹａｎ，ＬＩＵ Ｈｕａｍｉａｏ，ＸＩＮＧＸｉｕｍｅｉ∗∗ Ｓｔａｔｅ Ｋｅｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙｆｏｒ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ ｏｆ Ｓｐｅｃｉａｌ ＥｃｏｎｏｍｉｃＡｎｉｍａｌｓ，Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ ＳｐｅｃｉａｌＡｎｉｍａｌ ａｎｄ Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉｅｎｃｅ ｏｆ ＣＡＡＳ，Ｃｈａｎｇｃｈｕｎ １３０１１２，Ｃｈｉｎａ Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｉｎ ｔｈｉｓ ｓｔｕｄｙ，ｓｅｑｕｅｎｃｅｌｅｎｇｔｈｓｏｆ ｍｉｔｏｃｈｏｎｄｒｉａｌ ＤＮＡ ｏｆ２０ ｓｐｅｃｉｅｓｉｎ Ｃｅｒｖｉｄａｅｗｅｒｅ ｏｂ⁃ ｔａｉｎｅｄ ｆｒｏｍ ＧｅｎＢａｎｋ． Ｔｈｅ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ｂｅｔｗｅｅｎ ｂａｓｅ ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎｓ ａｎｄ ｇｅｎｅｔｉｃ ｄｉｓｔａｎｃｅｓ ｏｆ ｔｈｅ ｓｅ⁃ ｑｕｅｎｃｅｓｗａｓａｎａｌｙｚｅｄ．Ｔｈｅｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｗａｓｃｏｎｓｔｒｕｃｔｅｄｂｙ ＮＪ ｍｅｔｈｏｄ，ａｎｄｔｈｅｐｈｙｌｅｔｉｃ ｅｖｏｌｕ⁃ ｔｉｏｎ ｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ ａｍｏｎｇ Ｃｅｒｖｉｄａｅ ｗａｓ ｄｉｓｃｕｓｓｅｄ． Ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ ｔｈｅ ｌｅｎｇｔｈｓ ｏｆ ｔｈｅｉｒ ＋ ｍｔＤＮＡ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓｒａｎｇｅｄｆｒｏｍ １６３０５ｂｐｔｏ １６４８２ｂｐ，Ａ Ｔｃｏｎｔｅｎｔｗａｓ６２５８％，ａｎｄｇｅｎｅｔｉｃｄｉｓ⁃ ｔａｎｃｅ ｏｆ ｅａｃｈ ｓｐｅｃｉｅｓ ｒａｎｇｅｄ ｆｒｏｍ ００１４—０１６４． Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ Ａ．ａｌｃｅｓ ｉｓ ｔｈｅ ｍｏｓｔ ａｎｔｉｑｕｅ ｏｎｅ ａｍｏｎｇ ｔｈｅ ２０ Ｃｅｒｖｉｄａｅ ｓｐｅｃｉｅｓ；Ｅｌａｐｈｕｒｕｓ ｄａｖｉｄｉａｎｕｓ ａｎｄ Ｃｅｒｖｕｓ ｈａｄ ｃｌｏｓｅ ｒｅｌａ⁃ ｔｉｏｎｓｈｉｐ，Ｅｌａｐｈｕｒｕｓｄａｖｉｄｉａｎｕｓｓｈｏｕｌｄｂｅｉｎｃｏｒｐｏｒａｔｅｄｉｎ Ｃｅｒｖｕｓ；Ｒｕｃｅｒｖｕｓｄｕｖａｕｃ