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Magnetospira sp. QH-2 MamK 蛋白的结构和系统进化分析 1, 2, 3 1, 3 1, 2, 3 1, 3 1, 3 1, 3 滕兆洁 ，张文燕 ，刘 佳 ，董 逸 ，陈一然 ，潘红苗 ， 杜海舰1, 3 1, 3 1, 2, 3 1, 3 ，王明玲 ，徐 丛 ，肖 天 (1. , 266071; 2. , 100049; 3. 266071) 摘要: Magnetospira sp. QH-2 是一株分离自黄海潮间带的海洋趋磁螺菌, 该菌磁小体排列不整齐, 并且 磁小体链内某些区域排列疏松, 推测与其磁小体岛上的mamK 编码的MamK 蛋白相关。mamK 开放阅 读框大小为 1086 bp, 编码361 个氨基酸, MamK 蛋白属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin 超家族, 为 非跨膜蛋白; 此外, 还利用生物信息学工具预测 MamK 蛋白二级和三级结构。系统进化分析显示 MamK 蛋白的系统进化和 16S rRNA 基因的系统进化有一定差异, 推测磁小体岛的获得可能与菌种的 进化是独立的两个过程; 淡水与海水中的趋磁螺菌虽然形态相似, 但系统进化地位有一定差异, 可能 是两者不同生境下适应性演化的结果。 关键词: MamK; 系统进化; 16S rRNA 基因; 磁小体岛; 结构 中图分类号: Q811.4 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2016)07-0001-07 doi: 10.11759/hykx20151103001 (Magnetotactic bacteria, MTB) Fe S )[22], 3 4 , , Bellini [1-3], [23]  Blakemore Science , , [4] , , (magnetosome island, MAI), [24] [5-8] , mamABmamGFDCmamXY mms6 , α- (Alpha-Proteobacteria) γ- mamAB [25-27] (Gamma-Proteobacteria) δ- (Delta-Proteo- mamK mamAB MamK bacteria)(Nitrospirae)candidate phylum [9-11] [12] (Magnetosome filament, MF), Omnitrophica candidate phylum