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Axiomamp;trade;BOS1牛基因分型芯片.PDF
Axiom™ BOS1 牛基因分型芯片
最高的遗传覆盖,带来准确的性状选择
首先 对多个B. taurus和B. indicus品种的DNA进行测序
, ,
包括东亚 热带适应 肉牛和奶牛品种 发现超过4600万个
、 、 ,
SNP。随后根据Bos基因组的物理覆盖度和在其中发现SNP的
品种数量过滤SNP。
接着 在多块芯片上对大约400个样品进行基因分型 验证
, ,
了20个品种中大约300万个SNP (表1)。一半筛查样品来自
Bovine HapMap Consortium ,另一半来自Affymetrix®
Bovine Consortium
。
Axiom™ BOS 1牛基因分型芯片特有10种具有重要商业价 表1 :Affy met rix牛基因组数据库中包含的20个牛品种的多态性
SNP数量。
值的牛品种的最高遗传覆盖,实现了准确的遗传价值评估、全
基因组关联研究(GWAS)、生物多样性和连锁不平衡(LD)研 Breed No. of polymorphic
究,GWAS可鉴定出与疾病、药物反应及其他重要经济性状相 SNPs (millions)
Afrikander 1.4
关的变异。
Angus 1.4
Ayrshire 0.96
Axiom™ BOS1牛基因分型芯片的好处:
Blonde dAquitaine 0.99
■ 遗传覆盖比市场上其他芯片高34%之多
Boran 2.2
■ 肉牛和奶牛品种的最广泛覆盖
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