应用cDNA表达谱芯片研究子宫内膜癌.PDFVIP

维普资讯 2OO6年3月第 15卷第3期 ProgObstetGynecol，丛垒 ! ：竺：!曼!竺： · 论著 · 应用 cDNA表达谱芯片研究子宫内膜癌 基因的表达谱’ 蔡 斌 ，万小平”，刘 玲，席晓薇，杨懿霞 (上海交通大学附属第一人民医院妇产科，上海 200080) 【摘要1 目的：应用eDNA表达谱芯片研究不同分化程度人子宫内膜癌组织的基因 表达谱，分析子宫内膜癌发生、发展过程 中基因表达的变化。方法：用一步法抽提 5例高 分化和4例低分化人子宫内膜癌组织和 36例正常子宫内膜组织的总RNA，在反转录合 成 cDNA探针的同时以Cy3和 Cy5标记肿瘤组和正常对照组，将 Cy3和 Cy5标记探针混 合后与含有 13824个基因的人表达谱芯片杂交。经洗片、扫描、软件处理后，分析子宫内 膜癌和正常子宫内膜对照之间基因表达谱的差异。对高分化和低分化子宫内膜癌基因表 达谱进行聚类分析。结果：子宫内膜癌组织和正常对照基因表达谱比较，差异2倍以上基 因共有26条，表达上调和下调的基因分别为2条和 24条。聚类分析显示，通过基因表达 谱基本可将高分化和低分化子宫内膜癌分开。结论：通过基因表达谱差异研究可以发现 与子宫内膜癌发生、发展相关的基因；癌基因表达谱聚类分析可能会帮助判断高危和低危 子宫内膜癌 ，有利于子宫内膜癌患者个体化治疗方案的制定。 【关键词】 eDNA微阵列；子宫内膜肿瘤；基因表达谱；层次聚类分析 中图分类号：R737．33 文献标识码 ：A 文章编号：1004—7379(2006)03—0177—04 ．I1lestudy ofgeneexpression profiling in human endometrialcancer using eDNA mi- croarray．CaiBin，耽 nXiaoping， Ⅱ曲 ，eta1．DepartmentofObstetricsandGynecology， ShanghaiFirstPeoplesHospital。ShanghaiJ瑚． tong University。Shanghai 200080 【Abstract】 Objective：Tostudythegeneexpressionprofilinginendometrialcancerof differentgradebyusingeDNA mieroarray，explore thecancerrelatedgenesandhteirfunctionin htedevelopmentandprogressionofendometrial cancer．M ethods：ThetotalRNA 0f9casesof endometriodendometrial cnacerincluding5welldffierentiatedand4poodydifferentiatednad 36normalendometriam was isolatedandlabeledbyreversetranscriptionreactionwiht Cy3nad Cy5forcDNA probe．Equal qunatityoflabeledcDNAWas mixednadhybridizedtohtecDNA microarray，which contained 13824 genes．Afterwashing，scnaningand imageprocessing，hte dffierentgeneexpressionprofilingofendometrial cancernadnomr al controlWas naalysed．nle hierachical clusteranalysisWas applied tohte geneexpression profilingofwelldifferentiated nadpoorlydifferentiatedendometriatcancers．Results：Twenty．sixgeneshadmorehtantwoofld dffierentexpression，hteupregulatedna ddownregulatedgeneswere2and24。respectively．’nle welldffierentiatedna dpoorlydffierentia