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利用RAPD和ISSR分子标记对西瓜作图亲本的多态性分析.pdf

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利用RAPD和ISSR分子标记对西瓜作图亲本的多态性分析

1100 江苏农业学报(JiangsuJ.ofAgr.Sci.),2009,25(5):1100~1107 利用RAPD和ISSR分子标记对西瓜作图亲本的多态 性分析 1,2 2 1 2 2 羊杏平 , 刘 广 , 侯喜林 , 徐锦华 , 高长洲 (1南京农业大学园艺学院作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏 南京 210095;2江苏省农业科学院蔬菜研究所,江 苏 南京 210014) 2+   摘要: 以西瓜为材料,对基因组DNA的RAPD和ISSR分析体系中的Mg 、dNTPs和引物浓度进行了优化。 2+ 筛选出的RAPD优化体系(20 l)为:引物04 mol/L,dNTPs200 mol/L,Mg 20mmol/L,DNA20ng,1×Buffer μ μ μ 2+ 缓冲液,Taq酶 10U;ISSR优化体系(16 l)为:引物025 mol/L,dNTPs160 mol/L,Mg 10mmol/L,DNA20 μ μ μ ng,1×Buffer缓冲液,Taq酶064U。以远生态西瓜品种自交系641 3和6 2、及23 1和41 2为作图亲     本,利用筛选好的RAPD和ISSR体系对作图亲本的多态性进行分析。结果表明,在作图亲本641 3和6 2中,   181个RAPD引物中有11个引物不能有效扩增,其余 170个引物产生了525条扩增带,平均每个引物在基因组中 可检测到308个基因位点,其中可检测出多态性位点的引物有55个,产生了77条多态性扩增带,平均多态率为 1467%;62个ISSR引物中有17个引物不能有效扩增,其余45个引物产生了188条扩增带,平均每个引物产生了 418条扩增带,15个多态性引物可以在双亲间检测到多态性位点23个,平均每个多态性引物能扩增出153个多 态性位点,多态率为1223%。在作图亲本23 1和41 2中,利用499个RAPD引物进行了基因组的扩增,其中   43个引物为非有效引物,456个引物产生了1431条带,平均每个引物产生314条带,142个多态性引物检测到了 240个多态性基因位点,平均多态率为1677%。表明西瓜作图亲本间的遗传背景较狭窄。 关键词: 西瓜;RAPD;ISSR;体系优化;多态性分析 中图分类号: Q78   文献标识码: A   文章编号: 10004440(2009)05110008 PolymorphismAnalysesofWatermelon(Citrulluslanatus)MappingPar entsUsingRAPDandISSRMolecularMarkers 1,2 2 1 2 2 YANGXingping , LIUGuang, HOUXilin, XUJinhua, GAOChangzhou (1NationalKeyLaboratoryofCropGeneticsandGermplasmEnhancement,Colleg

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