植物学名校订工具.PDFVIP

生物多样性 2015, 23 (2): 252–253 doi: 10.17520/biods.2015055 Biodiversity Science http: // 植物学名校订工具 王钧杰 陈国科 马克平* ( 中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室, 北京 100093) Tools for standardization of plant names * Junjie Wang, Guoke Chen, Keping Ma State Key Laboratory of Vegetation and Environmental Change, Institute of Botany, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100093 近年来, 随着植物信息数字化的普及, 植物学 et al., 2013)。TNRS 目前的版本为3.2, 依据的数据源 领域出现了众多名称索引系统, 如英国皇家植物园 为Tropicos, Global Compositae Checklist (http://di- (邱园)和密苏里植物园共同创办并维护的The Plant /compositaeweb/), USDA List (/), 密苏里植物园维 Plants (/java/) 和NCBI Taxon- 护的Tropicos (/), 邱园、哈佛 omy (/Taxonomy/) 。 大学标本馆和澳大利亚国家标本馆共同维护的The 登录网站/TNR International Plant Names Index (IPNI, http://www. Sapp.html/即可使用TNRS, 这里作简单介绍(附图1): /), 中国科学院植物研究所维护的中国高等 第一步, 输入植物学名(种名、属名、科名等) 。 植物信息系统(/) 等, 这 TNRS 目前支持两种输入方式: 直接复制名录(5,000 些索引系统涉及数以百万计的植物名称。与此同时, 条以内)到网页上的文本框, 输入的名录不需加表 许多基于上述名称索引网站提供的应用程序编程 头, 不要有逗号等标点符号; 或者点击“Upload and 接口(API)进行名称批量校订的软件和工具包也被 Submit List”, 通过对话框上传文本文件(txt格式), 开发出来, 使得批量处理植物学名成为可能。对研 同时输入邮箱地址来接收验证码。 究人员而言, 通过电脑录入植物名称可能会产生拼 第二步, 在屏幕右侧的Name processing set- 写错误(Rees, 2014) 。此外，志书中也存在拼写或印 tings栏进行必要的设置(通常情况下使用默认设置), 刷错误, 如《中国植物志》中就有1,000多个学名存 点击“Submit List” (文本框右下角), 程序就会在后 在拼写问题(Liu et al., 2013)。面对大量的植物名称, 台自动进行名称校订, 校订完后会在另一个文本框 手动校订必然花费大量精力, 而使用一些应用程序 中显示结果。如果输入的是文本文件, 网站会将查 或软件包进行批量校订, 一方面节省时间, 另一方 询结果的验证码