4 种有机磷农药dna 适体的筛选及结构分析 - 南京农业大学学报.pdfVIP

摇 南京农业大学学报摇 2013,36(6):117-122 http:/ / 摇 Journal of NanjingAgricultural University doi:10.7685/ j.issn.1000-2030.2013.06.019 試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試試 王丽,刘贤金,张存政,等.4种有机磷农药DNA适体的筛选及结构分析[J].南京农业大学学报,2013,36(6):117-122 4 种有机磷农药DNA适体的筛选及结构分析 1,3 2* 2 2 1* 王丽 ,刘贤金 ,张存政 ,刘媛 ,屠康 (1.南京农业大学食品科技学院,江苏 南京210095;2.江苏省农业科学院食品质量安全与检测研究所/ 农业部食品质量 安全监控重点开放实验室,江苏 南京210014;3.安徽科技学院食品药品学院,安徽 凤阳233100) 摘要:利用SELEX技术从一个固定的随机 ssDNA 库中同时筛选甲拌磷、丙溴磷、水胺硫磷、氧化乐果4 种有机磷农药的 DNA适体。 随着筛选轮数的增加,4种有机磷农药从固定的随机库中洗脱的ssDNA逐渐富集,经过12轮的筛选,筛选效率 达到40.8%。 对第12轮洗脱的ssDNA进行克隆、测序,挑选的15个阳性克隆均测序成功,由于部分克隆具有完全一致的 序列,最终筛选到5条ssDNA序列。 一级结构序列分析表明5条ssDNA具有一定的同源性,二级结构预测表明5条ssDNA 的二级结构主要以茎环结构为主,表明茎环结构可能是适体结合4种有机磷农药的基础。 关键词:有机磷农药;DNA适体;指数富集的配体系统进化(SELEX);筛选;结构分析 中图分类号:Q789摇 摇 摇 摇 文献标志码:A摇 摇 摇 摇 文章编号:1000-2030(2013)06-0117-06 Selection and structure analysis of DNA aptamers which bind to four organophosphorus pesticides 1,3 2* 2 2 1* WANG Li ,LIU Xianjin ,ZHANG Cunzheng ,LIU Yuan ,TU Kang (1.College of Food Science and Technology,Nanjing Agricultural University,Nanjing210095,China;2.Institute of Food Quality Safety and Detection/ Key Laboratory of Food Safety Monitoring and Management,Ministy of Agriculture, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences,Nanjing210014,China;3.College of Food and Drug, Anhui Science and Technology University,Fengyang233100,China) Abstract:DNA aptamers against four organophosphorus pesticides (phorate,profenofos,isocarbophos and omethoate) were simultaneo