流感病毒RNA聚合酶活性分析——一种比PB1抑制活性更强的小肽的鉴定.pdfVIP

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流感病毒RNA聚合酶活性分析——一种比PB1抑制活性更强的小肽的鉴定

摘要 摘要 近些年来,高致病性的流感病毒肆虐全球,造成了严重人员死亡和大范围的 恐慌。在现有医疗水平和药物无法较好的预防和治疗由流感病毒引起的传染病的 条件下,研制出一种能够彻底抑制流感病毒的新药显得必要而且紧迫。 的RNA聚合酶由PA,PBI,PB2三个亚基组成,在病毒复制和转录中起着重要 作用。PBlN能够与PAc结合,抑制聚合酶的组装,从而阻止病毒的复制,是一 个良好的天然抑制剂。 我们以结构已知的PBlN端16肽为基础,设计了一系列6肽和8肽以及突 变小肽,测定与PAc的结合强弱。通过表面等离子共振和热稳定性等实验,我 们得到了一些比PBlN结合力更强的小肽,并得到了其中一种小肽与PAc蛋白质 复合物的2.8A晶体,经过结构解析后可以非常清楚的看到小肽结合在PAc的活 性部位。通过与文章报道的PAc与PBlN的复合物晶体结构相比,分辨率稍有提 高,结合力更强,从而为流感病毒RNA聚合酶的多肽抑制剂开发提供了新的思 路,有助于寻找真正抑制流感病毒的多肽药物。 关键词:流感病毒RNA聚合酶,抑制剂,蛋白质晶体,表面等离子共振, 热稳定性实验,多肽药物设计 Abstract Abs订act influenza the SO strainscause is Recentlyhighlypathogenic globalpandemic.It thatanew theinfluenzaAvirusis thecurrent urgent drugagainst needed,since cannot a efficient therapeuticsprovidecompletelyprotection. As Avirus to RNA belongOrthomyxoviridae,itsdependent reported,influenza RNA whichcontains1and crucial PA,PB PB2,has polymerase(RdRp)heterotrimer rolesinViralRNA and bindstoPA replicationtranscription.PB1(residues1-25)can the blocks of RNA (residue257-716)andassembly polymerasereplication,which a shows inhibitoryactivity. 900d InbaseofPB1 aseriesof the N,wedesigned peptides,calculatedbindingactivity with theSurfacePlasmonResonanceandThermalShift PAc.Afterusing Assay some whichrevealeda thanPB1

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