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专题研究(二) - 专题周记系统

專題研究 (二) 無穩定蛋白質區域的序列與功能分析 指導教授: 游景 盛 老師 學 生:資訊三甲 D9985717 陳乃華 資訊三乙 D9818358 洪潔慧 日 期 :民國一○一年 十一月二十三日 進度目標 將關鍵字搜尋的 結果,增加一些資訊欄位,如:物種來源、以及第三方資料 庫 GO(Gene Ontology的) 相關訊息。 增加可列入無穩定區域相關研究範圍的 二級結構亂度分析 函數圖形 由, 於無 法透過一級結構預測蛋白質無穩定區域 雖不, 在發表內容之內,但嘗試從 二級結 構分析無穩定區域 :從二 級結構中 ,嘗試 將每一結構 特性的亂度分析 作 Normalize(Z值 分佈 )以預測無穩定區域 。 已完成的進度 網頁的關鍵字搜尋、 序列搜尋,相關查詢 結果的原亂度分析圖、正規化後的 亂度分析圖 ,由於是對 5種二級結構作分析,將逐一取值 ,以嘗試可能的 無穩定 區域預測方向。 ↑圖一每一二級結構的亂度分析圖 以下列出網頁服務相關蒐尋 以及搜尋結果 。 圖二 :搜尋關鍵字 主畫面 圖三 :搜雲結果相關列表 圖 四:列表項目連結 圖四為使用者點擊項目後的連結畫面。 將所有 Swiss-Prot項目列在左側, 相關函數圖星輸出 在右側, 而Z值分布相關函數圖形尚未作可行性 分析確認。 需 再作可能的最佳化平滑處理,或是只取亂度分析 。 依不同二級結構的排列組合分析Z值分佈 可能, 可以藉此分析無穩定區欲的 預測結果,但是也可能 不行,因 此網頁服務方面較偏向蛋白質 序列無穩定區相關 的 功能列表查詢。 工作分配 人員 工作內容 洪潔慧 程式撰寫 、伺服架設、系統測試、相關資訊了解,網頁架設 、網頁介 面設計 陳乃華 文件整理 、網頁介面設計、相關背景整理

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