利什曼原虫去乙酰化酶sir2的序列分析和结构预测第一组 - abc.pdfVIP

利什曼原虫去乙酰化酶SIR2的序列分析和 结构预测 Sequence analysis and structure prediction of SIR2 in leishmania 第一组：左云云 单兴娜 李建秋 陈新新 2013.6.21 报告内容 1、背景知识介绍及研究的目的意义 2、SIR2的进化分析，构建发育树 3、SIR2的核酸序列分析 4、SIR2的蛋白序列分析及结构预测 利什曼原虫病 利什曼病（Leishmaniasis）又名利什曼原 虫病。是由利什曼原虫(Leishmania)寄生在 人和犬、野生动物、爬行类动物中的一种 常见的寄生虫病。该病能引起皮肤或内脏 器官的严重损害甚至坏死。该病在大多数 地区是人兽共患病。在不同国家与地区流 行的利什曼病，其主要侵害部位不同.引起 我国利什曼原虫病的病原是杜氏利什曼原 虫。主要引起皮肤黑热病和内脏利什曼原 虫病。 疾病病原 利什曼原虫与锥虫同属一个科，即锥虫科 (Trypanosomatidae)。利什曼原虫随着生活史 的不同阶段而表现出不同的形态。按其生活史 的共同特点有前鞭毛体(Promastigote)和无鞭 毛体(amastigote)两个时期，前鞭毛体寄生在 无脊椎动物的消化道内，其宿主为白蛉(Phl ebotomusSpp.) 。无鞭毛体寄生在脊椎动物的 网状内皮细胞内，其宿主为哺乳类和爬行类动 物。 人兽共患机制 内脏利什曼病或黑热病病原贮藏在家犬体 内。再由犬类传给人类，成为人兽共传的 传染病。 SIR2的背景知识介绍及研究的目的意义 SIR2 (silence information regulator)基因家族是 一种保守的从古细菌到哺乳动物都存在的NAD+ 依赖的组蛋白/ 非组蛋白去乙酰化酶。在酵母中， SIR2连同与它相互作用的几个蛋白质在基因沉默、 基因组稳定性、细胞寿命以及代谢调节上起着不 可缺少的作用。在哺乳动物中，有7 个SIR2 同源 基因，分别命名为SIRT1 到SIRT7。 SIR2催化的去乙酰反应方程式：NAD+ 乙酰化赖 氨酸→ 烟酰胺+ 乙酰-ADP-核糖＋去乙酰化的赖 氨酸 参考生物-酿酒酵母 酵母SIR2 由两个结构域组成，大的结构域由6 个a 螺旋和6 个平行b 折叠组成，小的结构域由3 个反 平行b 折叠，2 个a 螺旋和1 个锌原子组成；另外 还有一系列环状结构与这两个结构域相连，并在其 核心区域的中间形成一个裂缝。 乙酰化的赖氨酸残基和辅助因子NAD+ 结合在裂缝 的对面。 SIR2 核心区域高度的序列保守性，暗示其保守的 催化机制。 目的意义 寄生虫中这类蛋白研究较少。 利用生物信息软件分析利什曼原虫SIR2蛋 白的相关序列和预测其蛋白结构，并分析 SIR2蛋白与底物结合位点与特点，根据作 用靶点找出其抑制剂，应用于抗虫药物研 究。 2、SIR2的进化分析，构建发育树 3、SIR2的核酸序列分析 位于第26号染色体，从55441-56562，共 1121个碱基 没有内含子 所在 位置 密码子使用分析cusp： 