含磷酸结合口袋的brct 结构域功能位点预测 - zoological research.pdfVIP

动 物 学 研 究 2011, Oct. 32(5): 509−514 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research DOI ：10.3724/SP.J.1141.2011.05509 含磷酸结合口袋的 BRCT 结构域功能位点预测 1, 2 1, 3,* 盛自章 , 黄京飞 ( 1. 中国科学院昆明动物研究所 遗传资源与进化国家重点实验室, 云南 昆明 650223; 2. 中国科学院研究生院, 北京 100049; 3. 中国科学院昆明动物研究所和香港中文大学生物多样性和人类疾病模型联合研究中心, 云南 昆明 650223) 摘要：BRCT( BRCA1 C-terminus)是真核生物DNA 损伤修复系统重要的信号传导和蛋白靶向结构域。为了探 讨含磷酸结合口袋的BRCT 与磷酸化配体结合的机制, 对XRCC1 BRCT1 、PTIP BRCT4 、ECT2 BRCT1 和 TopBP1 BRCT1 进行了结构保守性和表面静电势分析。结果显示, 4 个BRCT 的磷酸结合口袋周围所存在的结构保守并带 正电势的沟槽很可能是其功能位点, 并且类似的沟槽在含磷酸结合口袋的BRCT 中普遍存在。沟槽两侧及底部均 带有极性氨基酸残基, 两侧带正电荷, 而底部疏水。这说明沟槽与配体的结合以静电和疏水相互作用为主。沟槽 主要位于单个BRCT 中，而且4 个BRCT 的沟槽在形状和电荷分布上都不同, 说确明BRCT 配体特异性主要由单 个BRCT 决定。磷酸结合口袋位于沟槽中心, 说明沟槽可能同时结合磷酸化残基的N 端和C 端附近残基。 关键词：BRCT 结构域；磷酸结合口袋；DNA 损伤修复；表面静电势 中图分类号：Q5-3; Q811.4; TP399; R711.75 文献标志码：A 文章编号：0254-5853-(2011)05-0509-06 Functional site prediction of BRCT domain containing phosphate binding pocket SHENG Zi-Zhang 1, 2 , HUANG Jing-Fei 1, 3,* (1. State Key Laboratory of Genetic Resources and Evolution, Kunming Institute of Zoology, the Chinese Academy of Sciences, Kunming 650223 China; 2. Graduate School of the Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049 China; 3. Kunming Institute of Zoology-Chinese University of Hong Kong Joint Research Center for Bio-resources and Human Disease Mechanisms, Kunming 650223, China) Abs