土壤微生物脂肪酸分布特性的研究 - yzxzcom.docVIP

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2017-08-16 发布于天津
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土壤微生物群落脂肪酸生物标记分析软件林营志刘波张秋芳福建省农科院农业生物资源研究所福建福州摘要磷脂脂肪酸法是一种可用于定性和定量分析土壤微生物群落多样性的方法本软件以为开发语言以系统的样品脂肪酸检测文件为数据源自动提取文件脂肪酸数据构建数据矩阵计算批次样品的磷脂脂肪酸特征计算多样性指数丰富度指数和均匀度优势度指数等多样性指数进而根据实验设计的平行处理和重复信息计算平均值和标准差并调用统计软件模块进行聚类分析和主成份分析本软件可应用于基于磷脂脂肪酸的土壤微生物群落多样性研究提高分析效率关键词前言土

土壤微生物群落脂肪酸生物标记分析软件林营志，刘波，张秋芳 (福建省农科院农业生物资源研究所，福建福州 350003) 摘要：磷脂脂肪酸(PLFAs)法是一种可用于定性和定量分析土壤微生物群落多样性的方法。本软件以Perl为开发语言，以MIDI系统的样品脂肪酸检测文件为数据源，自动提取文件脂肪酸数据，构建数据矩阵；计算批次样品的磷脂脂肪酸特征，计算Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)、 McIntosh多样性指数(H3)、丰富度指数(S)和Pielou均匀度(J)、Simpson优势度指数(D)等多样性指数；进而根据实验设计的平行处理和重复信息计算平均值和标准差