上海生命科学数据中心的设计与实现.pdfVIP

第25卷第4期 计算机应用与软件 VoI．25 No．4 2008年4月 Computer Applications and Software Apr．2008 上海生命科学数据中心的设计与实现 许庆炜 曹顺良 李 荣 张国庆 骆清铭 李亦学 (华中科技大学湖北省生物信息与分子成像重点实验室 湖北武汉430074) (上海生物信息技术研究中心 上海200235) 摘 要 上海生命科学数据中心通过整合实验数据、分析工具、相关文献，为研究人员提供一个具有中国特色、地方特点，以知识 为导向、技术前瞻的生命科学数据共享、服务支撑平台。平台针对生命科学数据自身的特点，运用必威体育精装版技术手段，在海量数据的管 理、异构数据的整合、分布式数据访问，以及数据安全性管理方面进行了积极、有益的探索。目前，平台一期工作已经完成，并开始对 外提供服务(http：／／lifecenter．sgst．cn／)。 关键词 生命科学 数据整合 Oracle数据库 分布式管理 DESIGN AND IMPLEMENTATIoN oF SHANGHAI CENTER FoR LIFE SCIENCE ＆ BIoTECHNoLoGY INFoRMATIoN Xu Qingwei。Cao Shunliang Li Rong Zhang Guoqing。Luo Qingming。 Li Yixue (Hubei Bioinforn~tics and Molecu~r Imaging Key Laboratory，Huazhong University ofScience and Technology，Wuhan 430074， 6e ，China) (Shanghai Centerfor Bioinformation Technology，Shanghai 200235，China) Abstract Through the integration of experimental data，analytical tools and related literatures，Shanghai Center for Life Science＆Biotech— nology Information provides researchers with a data sharing and services supporting platform．The platform has Chinese characteristics and local features，and it is knowledge—guided with cutting—edge technology．Considering the large—scale，heterogeneous，and distributed nature of life sci． ence data，this platform makes a very valuable exploration in data management．The platform is available at http：／／lifecenter．sgst．cn／． Keywords Life science Data integration Oracle database Distributed management 合实验数据、分析工具、相关文献，为研究人员提供一个具有中 0 引 言 国特色、地方特点、以知识为导向、技术前瞻的生命科学数据中 心已经迫在眉睫。 随着生命科学研究的不断进步，特别是自动化和高通量技 术的广泛应用，产生了数量庞大，种类繁多的数据。这些