西施舌3个群体H2A基因和nad6-nad1片段序列比较.PDF

西施舌 3 个群体 H2A 基因和 nad6-nad1 片段序列比较研究 朱 明, 申 欣, 朱笑琳, 屠海淼, 杨 婕, 孟学平 ( , , 222005) 摘要: 西施舌(Coelomactra antiquata)浮游幼虫EST 序列拼接获得组蛋白H2A ORF 及其两翼的非编码 区, 在ORF 两翼设计引物Can-H2AF 和Can-H2AR, 扩增H2A 基因片段; 从nad6 3′端和nad1 5 ′端设 计引物, 扩增两基因区域DNA 序列, 测序并进行核苷酸序列差异分析, 研究漳州西施舌分化水平。结 果: 共获得西施舌3 个群体H2A 基因606bp 或616bp 基因区DNA 片段23 条, 检测到9 种基因型(Gen) 。 西施舌漳州群体H2A 基因AT 含量(51.51%) 高于日照、北海群体AT 含量(50.58%); 序列比对分析显示, 简约信息位点占4.05% 。基于H2A 基因的漳州群体与日照/ 北海混合群体间遗传距离平均为0.044, 漳 州群体, 混合群体内遗传距离分别为0.003 和0.004, 群体间与群体内遗传距离之比为11~14.7; AMOVA 分析结果显示, 漳州群体和混合群体间发生了极显著遗传分化(F ST =0.937, P0.01) 。从nad6~nad1 片段 中共检出7 种单倍型(Hap), 漳州群体与日照群体无共享单倍型, 基于 nad6~nad1 的漳州群体与日照群 体间遗传距离为0.199~0.202, 群体间与群体内遗传距离之比50~66, 两个群体间nad1 多肽链一级结构 存在极大差异, 有9 个位点的氨基酸不同, 日照西施舌缺失6 个氨基酸。线粒体DNA 显示西施舌漳州 与日照群体发生了明显的遗传分化。 关键词: 西施舌(Coelomactra antiquata); 组蛋白H2A 基因; nad6-nad1 区域; 遗传分化 中图分类号: Q959 文献标识码: A 文章编号: 1000-3096(2015)09-0026-07 doi: 10.11759/hykx20130803001 [1-2] [1] , 2 (AFLP) 16S rRNA [3] mRNA , 1(ITS1)[4] c 1 (cox1)[5] 34 , b (cob)[6]DNA DNA , [15] , ( , H3 ) H3 1 , H3 ()[1] H3 4 H2A [7] , H2A , RAPD , [8] () , , ,