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ゲノムデータベース论 - 日本バイオインフォマティクス学会
日本バイオインフォマティクス学会バイオインフォマティクスカリキュラム中間報告 カリキュラム検討委員会 カリキュラム検討委員会 バイオインフォマティクス教育の位置付け 育成される人間像 BIカリキュラム概要 分子生物学入門(1) 分子生物学入門(2) プログラミング入門 バイオインフォマティクス概論 学部教育 大学院教育(基本項目) 大学院教育(選択項目) 謝辞 * 委員長 小長谷 明彦 (北陸先端大?理研GSC) 委員 有田 正規 (産総研) 宮野 悟 (東大?京大) 森 浩禎 (奈良先端大) 八尾 徹 (理研GSC) 難易度 年齢 一般啓蒙教育 バイオ インフォマ ティクス 技術者教育 バイオ インフォマティクス 大学院教育 テクニシャン 育成 中核的 研究者?技術者 育成 情報系 バイオ系 大学教育 OJD 情報系 バイオ系 バイオ インフォ系 ?バイオがわかる情報研究者?技術者 ?コンピュータを使えるバイオ研究者?技術者 ?情報系およびバイオ系をまとめるコーディネータ的研究者?技術者 数学 物理化学 分野 生命 医学分野 学部レベル 大学院レベル リテラシー教育 基本科目 専門科目 分子 生物学 入門 プログラミング 入門 主テーマ 副 副 主テーマ 副 副 主テーマ 副 副 研究 プログラム (異分野の補完) OR OR OR バイオインフォ マティクス 概論 バイオインフォマ ティクスと社会 応用BI特論(医療) 配列アルゴリズム論 配列情報解析論 パターン認識論 ゲノム進化論 分子モデル論 分子構造論 分子機能論 知識情報処理論 システム生物学 応用BI特論(工学) 数理統計特論 統計解析特論 最適制御特論 遺伝解析特論 計算化学特論 画像解析特論 高速計算特論 情報 分野 ゲノムデータベース論 ?DNA、RNAからアミノ酸 化学結合、セントラルドグマ、遺伝子構造、転写、翻訳 ?アミノ酸からタンパク質 タンパク質、アミノ酸の性質と構造、機能 ?核、細胞質、細胞膜 ゲノム構造、細胞膜、膜タンパク質 ?原核生物、真核生物 原核真核の違いと進化、細胞小器官、代謝 ?細胞のライフサイクル 細胞分裂、細胞周期、分化、情報伝達 ?シーケンシング、cDNAライブラリ ?配列アラインメント ?ゲノム構造と遺伝子予測 ?データベース検索 ?転写シグナル、発現制御 ?ゲノム比較 ?タンパク質の構造、活性部位と機能 ?分子間ポテンシャル ?タンパク質の構造分類 ?タンパク質の構造予測 ?発現プロファイルとプロテオーム、メタボローム解析 ?酵素反応とタンパク質相互作用 ?システムとしての生命理解 UNIXファイル構造とshell Shellコマンド ホームページ作成 WWW上のデータベース利用法 Perlプログラミング プログラミング言語の基礎 配列解析の基礎 BLAST検索、検索結果の処理、WWW上の解析ツール 遺伝子アノテーション 文字列処理とデータベース タンパク質のデータベース 構造分類とスレッディング入門 WWWページ作成 HTML JAVAアプレット 細胞制御 細胞の構造と働き 細胞と病理 分子進化 遺伝解析 組替えDNA技術 生命?医学分野 数学?物理化学分野 解析学 線形代数学 確率論 統計論 情報分野 離散構造 論理学 アルゴリズム プログラミング言語 データベース 知能システム 数値計算 物理学 有機化学 タンパク質の物理 バイオインフォマ ティクスと社会 生物進化 歴史 特許 倫理 分子機能論 構造分類 酵素機能 システム生物学 生体モデリング 生体システム制御 ネットワーク解析 ゲノムデータベース論 ゲノム計画 ゲノムデータベース データベース処理技術 配列アルゴリズム論 DP、アラインメント マルチプルアラインメント RNA二次構造 配列情報解析論 文字列照合 配列数理統計 配列情報量 ゲノム進化論 置換確率モデル 進化系統樹 比較ゲノム、分子進化 分子モデル論 構造決定 配座エネルギー計算 分子力学 基準振動解析 分子構造論 二次構造、膜貫通部位 立体構造予測 分子設計 知識情報処理論 データマイニング 遺伝子発現 プロテオーム解析 メタボローム解析 パターン認識論 特徴抽出と判別分析 ベイズ推定 隠れマルコフモデル ニューラルネットワーク 数理統計特論 確率統計 確率母関数 マルコフ連鎖 ランダムプロセス 最適制御特論 フィードバック制御 伝達関数 安定性判別 最適化手法 統計解析特論 分散解析 回帰分析 重回帰モデル 時系列分析 主成分分析 画像解析特論 画像処理技術 画像比較 NMRスペクトル分析 高速計算特論 並列プログラム 並列アルゴリズム 分散処理 専用ハードウエア 応用BI特論(医療)
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