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分子生物学在白血病中的应用 2016-3-8 融合基因实验室 一、白血病相关基因改变的常见类型 融合基因 基因突变 基因表达异常 1. 融合基因: 所谓融合基因,是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增?强子、核糖体结合序列、终止子等)控制之下,构成的嵌合基因。 概 念 Chr 9 Chr 22 ABL BCR BCR-ABL融合基因 2. 基因突变: 错义突变(点突变) 插入突变 缺失突变 移码突变 错义突变(点突变): DNA分子中一个碱基对被另一个不同的碱基对取代所引起的突变。 如: JAK2V617F JAK2基因 mRNA水平(cDNA水平):第1849位点G突变为T 蛋白水平:第617位氨基酸位点由缬氨酸(V)突变 为笨丙氨酸(F) 插入突变: 较长片段的DNA的插入而发生突变,但不改变阅读框 如: NOTCH1 H1590-L1592insFGP NOTCH1基因 mRNA水平(cDNA水平):cns(TGGGCC) 蛋白水平: H1590-L1592insFGP 缺失突变: 较长片段的DNA的缺失而发生突变 ,但不改变阅读框 如: JAK2 N542-E543del JAK2基因 mRNA水平(cDNA水平): c.1624-1629 del 6bp 蛋白水平:N542-E543 缺失N、E氨基酸 移码突变: DNA片段中某一位点插入或丢失一个或几个(非3或3的倍数 碱基对时,造成插入或丢失位点以后的一系列编码顺序发生 错位的一种突变。 如:CALR L367fs(46) 突变 CALR基因 mRNA水平(cDNA水平): c.1179_1230del 52bp 蛋白水平:第367位氨基酸(亮氨酸)位点发生移码,在 367位点起后的46位氨基酸终止。 癌基因或抑癌基因表达异常 如: WT1定量 3、基因表达异常 二、白血病基因检测的临床意义 1、 辅助诊断 2、 指导治疗 3、 评估预后 4、 微小病变残留检测 三、白血病相关基因分类 BCR-ABL FLT3-ITD JAK2V617F C-KIT …… PML-RARa NPM1 RUNX1 AML1-ETO …… DNMT3A TET2 ASXL1/ASXL2 IDH1/IDH2 …… SF3B1 SRSF2 U2AF1 …… Class 1 增 殖 Class 2 分 化 Class 3 表观遗传 Class 4 剪切因子 四、白血病相关常见基因 AML CML MPN ALL CLL MDS AML 相 关 基 因 异 常 融合基因: 1、 PML-RARa: 95% AML-M3 分为三型 L型、S型、V 型 PLZF-RARa NPM1 -RARa 2、 AML1-ETO: 40% AML-M2 (主要为M2b) 3、 CBFβ-MYH11:90% AML-M4Eo 4、 MLL-AF17 MLL-AF6 AML-M4 /M5 MLL-AF9 AML 相 关 基 因 异 常 基因突变: FLT3-ITD NPM1(A/B/D型) c-Kit IDH1 IDH2 ASXL2 NRAS KRAS P53 DNMT3A 基因定量分析: WT1 定量 FLT3-ITD:AML-M3中发生频率较高 c-Kit: 50%AML1-ETO阳性AML CBFβ-MYH11阳性AML ASXL2:AML1-ETO阳性AML CML 相 关 基 因 异 常 BCR-ABL : 95%CML CML特
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