二维电泳及iTRAQ的实验比较_潘三强.pdf

Sep. 　2008　　24 ( 5) 　538 ～542 神 经 解 剖 学 杂 志 ( Ch in ese Journa l of Neuroana tom y) 二维电泳和 i TRAQ 的实验比较 潘三强 　宿宝贵 　吕来清 (暨南大学医学院　人体解剖学教研室 , 广州 510632 ) 摘 　要 　对蛋白组学中的二维电泳和 iTRAQ 两种技术进行比较研究 ,为神经科学的蛋白组学研究提供选择参考 。取生后 1～3 d C57B l/ 6 小鼠背根神经节进行培养 ,对照组加 DM SO ,实验组加 JNJ460。分别用二维电泳和 iTRAQ 两种技术检测背根神经节细 胞蛋白的变化 ,用 4700 TOF / TOF 串联飞行质谱仪检测变化蛋白的肽片段质量 ,用 GPS软件检索 M ascot蛋白质数据库 ,鉴定出匹 配的蛋白。利用二维电泳技术观察到 4 种表达上调的蛋白, 2 种是结构蛋白, 2 种是信号转导蛋白。利用 iTRAQ 技术观察到 22 种表达上调的蛋白,其中 10 种是结构蛋白, 3种是信号蛋白, 2 种是代谢蛋白, 2 种是降解蛋白化 , 2 种是细胞基质蛋白及 3 种其 它蛋白。利用二维电泳技术观察到发生表达变化的蛋白都位于胞浆内,而利用 iTRAQ 技术观察到的表达变化的蛋白有胞浆蛋 白外 ,还有线粒体蛋白、膜蛋白和核蛋白。同时 ,利用二维电泳技术观察到的蛋白变化都在 2 倍以上 ,而利用 iTRAQ 技术计算出 的蛋白变化在 1. 3至 1. 6倍之间。另 , iTRAQ 技术在鉴定大分子和小分子蛋白方面也有优势 。结果表明 iTRAQ 技术比二维电泳 技术能发现更多数量和更多种类的蛋白,但在比较胞浆蛋白的变化及蛋白量的变化方面二维电泳技术有一定的长处 ,对 iTRAQ 的实验结果有互补作用 。 关键词 　　二维电泳 　iTRAQ　蛋白组学 　背根神经节 A com para tive study between the two d im en siona l gel electrophore sis and iTRA Q m ethod P an S anqiang, S u B aog u i, L üL a iqing (D ep artm ent of Anatomy, M edical College of J inan Un iversity, Guangzhou 510632) Ab stract　The p resent study p rovided a reference for the neu rop roteom ic s study through comp arison between the two dim en sional gel elec trop horesis (2 D E) and isobaric tags for relative and ab solu te quantification ( iTRAQ ) m ethod. The dorsal root ganglia (DR G) were cu l tu red from 1 to 3 d po stnatal C57B l/ 6 m ice.