上海交通大学遗传学课件数量遗传学2016资料.ppt

数量遗传学 基本概念 数量性状 质量性状 表现型(phenotype)，表现型变异(phenotypic variation) 基因型(genotype)，遗传型变异(genotypic variation) 非遗传型随机误差(random error) 方差(variation)——个体的变异程度 公式：s2＝ 1/n [(x1－ x )2＋(x2－ x )2＋…＋(xn－ x )2] 有差、方、和、均四步运算。差是减法，方是平方，和是加法，均则为除法，就是求差、方的平均值，这也是“方差”的由来。 　　②方差的单位是已知数据的平方单位。 标准差(Standard Deviation) 各数据偏离平均数的距离（离均差）的平均数，它是离差平方和平均后的方根。用σ表示。因此，标准差也是一种平均数标准差能反映一个数据集的离散程度。平均数相同的，标准差未必相同。 数量性状的遗传特征 加性效应(additive effect)：基因位点内等位基因（allele）的累加效应 显性效应:(dominance effect):基因位点内等位基因（allele）之间的互作效应 上位性效应(epitasis effect) 加性-显性模型： 基因型值G=A+D+e 加性-显性-上位性模型: 基因型值G=A+D+I+e 遗传力:某性状的遗传变异占表现型变异相对比率 简单的数量性状 广义遗传力：总遗传变异（方差）/表型变异（方差） 狭义遗传力：加性遗传方差/表性方差 目前明确，群体表现型变异的遗传原因： 基因型变异、基因型*环境互作 普通广义遗传力，互作广义遗传力 加性-显性模型 加性-显性-上位性模型 主基因加多基因混合模型 近亲繁殖与杂种优势 杂交hybridization 异交outbreeding 近交inbreeding 全同胞 full-sib 半同胞 half-sib first cousin 自交 Selfing 回交 Back cross 轮回亲本 recurrent parent 非轮回亲本 non- recurrent parent 近交指数（F） 个体某基因位点两个等基因来源于共同祖先某个基因的概率 个体的近交系数=双亲的共祖系数（0~1） 亲缘程度越紧，近交系数越大。 近交与杂交的遗传学效应 遗传学效应 1. 基因分离 2. 等位基因纯合 遗传性状稳定 回交意义 测交，3个遗传规律 纯合速度快 自交：每种基因型纯合速度： (1-1/2r ) n ×(1/2) n 回交 ：纯合速度： (1-1/2r ) n 近交系数对群体表现的影响 近交衰退，群体均值下降 杂种优势 杂种优势涉及性状——大多为数量性状 双亲差异大、远缘 亲本高度纯合 理论基础： 显性假说dominance hypothesis 显性基因比隐性基因有利！ A× B F1 F1（显性基因积聚） × F2 （隐性基因纯合） 被许多实验证实 局限性：显隐性关系，不能解释数量性状的杂种优势 超显性假说Over dominance hypothesis,  super dominance hypothesis 等位基因异质结合 1908(Shull,G.H. East,E.M.)杂合性,引起某些生理刺激 1936(East,E.M.)补充：异质基因间的互作（显性作用） 1949,1955（Fisher,R. A.1949,Mather,K.1955）: 数量性状基因各种遗传效应的综合作用（加、显、上位性及其与环境的作用）