SherlockMIS系统应用于土壤细菌鉴定研究3.PDFVIP

第 43 卷 第 4 期 土 　壤 　学 　报 Vol43 ,No4 2006 年 7 月 ACTA PEDOLOGICA SINICA 　July ,2006 Sherlock MIS 系统应用于土壤细菌鉴定的研究 吴愉萍 　徐建明 　汪海珍 　胡宝兰 　吴建军 (浙江大学土水资源与环境研究所 ,杭州 　　310029) ( ) 摘 　要 　　以 10 种已知菌株为例 ,对 Sherlock 微生物鉴定系统 Sherlock MIS 的细菌鉴定准确性及培养 基 、活化时间和取样区域等因素对鉴定结果的影响进行了研究 。结果表明该系统对 TSBA 培养基培养的细菌 的鉴定准确率很高 ,除苏云金杆菌外其他菌株均鉴定到种的水平 ;但选用牛肉膏蛋白胨培养基培养细菌后 ,系 统对供试菌株鉴定效果不理想 。不同活化处理中所有样品的鉴定结果均正确 ,但以菌种活化 2 次后的 SI 值 ( ) 相似指数 更高 ;取菌在二区或是三区则对鉴定结果影响不大 。 关键词 　　Sherlock MIS ;细菌鉴定 ;磷脂脂肪酸 中图分类号 　　Q9381 　　　　　文献标识码 　　A 　　微生物是土壤最重要的生物体 ,能够降解土壤 lock MIS 系统主要用于医学 、防疫学或出入境检验 中的有机污染物或驱动土壤有机污染物的代谢过 检疫等领域的特别研究 ,在土壤 、农业 、环境科学等 程 。历经几十年的研究和发展 ,人们已从有机物污 领域的应用尚很少涉及 。PiotrowskaSeget 等运用该 染的土壤中筛选和分离出了许多专性的降解菌 ,并 系统鉴定了重金属污染土壤中的耐性菌[7 ] 。Oka 等 通过降解基因的克隆、表达调控等现代分子生物学 对该系统在鉴定土壤或根际微生物中的效果也予以 技术构建了各种基因工程菌 , 已在去除土壤环境中 了肯定[8 ] 。但是 ,有关阐述 Sherlock MIS 系统在微生 的有机污染物发挥了很重要的作用[ 1～4 ] 。因此 ,在 物鉴定条件方面的文献还未见详细报道 ,而且该系 研究污染土壤的生物修复或寻求高效的污染物削减 统在我国土壤微生物鉴定中的应用几乎空 白。为 的新原理和新技术等领域中 ,快速准确鉴定污染物 此 ,本文运用 Sherlock MIS 微生物鉴定系统 ,探讨了 的降解菌种类是一项最根本和具有特殊意义 的 该系统对细菌鉴定的准确性以及培养基 、活化时间 工作 。 和取样区域等因素对鉴定结果的影响 ,试图为 Sher 传统菌株鉴定方法大多是操作步骤复杂 、比较 lock 微生物鉴定系统广泛应用于我国土壤和环境科 费时且成本较高等[5 ] , 因而微生物鉴定 自动化系统 学领域的研究提供理论和技术依据 。 的开发和运用得到了越来越广泛的关注 。Sherlock Microbial Identification System (MIS) 就是一套由美国 1 　材料与方法 MIDI 公司开发成功的微生物鉴定 自动化系统 ,该系 统操作安全 、简单 、快速 ,实验成本也相对较低 。它 11 　材料 主要根据不 同种类微生物细胞膜 中磷脂脂肪酸