基于计算机模拟的拟糖三肽的设计与合成 - 上海有机化学研究所.PDFVIP

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2017-06-13 发布于天津
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基于计算机模拟的拟糖三肽的设计与合成 - 上海有机化学研究所

2004 年第 62 卷化学学报 Vol. 62 , 2004 第 2 期 , 199～203 ACTA CHIMICA SINICA No. 2 , 199 ～203 基于计算机模拟的拟糖三肽的设计与合成 a a , a b b 单　丽　　徐杰诚　　夏宗芗　　李家大　　王克夷 ( a 中国科学院上海有机化学研究所生命有机化学国家重点实验室　上海 200032) ( b 中国科学院上海生命科学院生物化学与细胞生物学研究所　上海 200031) 摘要　基于噬菌体展示的结果 ,对三种拟糖多肽与葡糖淀粉酶的相互作用进行了分子动力学模拟. 计算机模拟结果表明 , ( ) 多肽 N端碱性氨基酸残基可与酶的活性中心结合. 在此基础上 ,设计并用液相法合成了 3 个三肽 RSA , KSA , RCA ,用于 α 制备与葡糖淀粉酶或淀粉酶的复合物的晶体. 关键词　葡糖淀粉酶 ,拟糖多肽 ,计算机模拟 ,液相合成 Design and Synthesis of Glycoreplica Tripeptides Based on Molecular Modeling SHAN , Li a 　　XU , JieChenga 　　XIA , ZongXiang , a 　　LI , JiaDa b 　　WANG, KeYi b ( a State Key Laboratory of Bioorganic and Natural Products Chemistry , Shanghai Institute of Organic Chemistry , Chinese Academy of Sciences , Shanghai 200032) ( b Institute of Biochemistry and Cell Biology , Shanghai Institutes for Biological Sciences , ) Chinese Academy of Sciences , Shanghai 200031 Abstract 　Based on the results of phage display , the interactions between three glycoreplica peptides and glucoamylase were investigated by molecular dynamics simulation. The results of the comp