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第十一节 表观遗传学与肿瘤
第十一节 表观遗传学与肿瘤 1、表观遗传学:是研究基因的核苷酸序列不发生改变的情况下,基因表达了可遗传的变化 的一门遗传学分支学科。表观遗传学机制包括:DNA 甲基化异常,组蛋白修饰,非编码 RNAs(包括 microRNA) ,染色质重塑等,而这几个方面都与肿瘤的发生有关。 2、肿瘤表观遗传学机制 (1)DNA 甲基化异常与肿瘤发生 DNA 甲基化修饰在肿瘤形成和发展中扮演重要角色,这里所指的 DNA 异常甲基化可 分为高甲基化和低甲基化,前者指正常组织细胞中 DNA 不发生甲基化的位点被甲基化.后 者是指在正常组织细胞中应发生甲基化的位点去甲基化。 DNA 低甲基化导致肿瘤的发生:正常细胞内, 启动子区的胞嘧啶—磷酸—鸟嘌呤 (CpG )岛呈非甲基化状态,而大部分散在分布的CpG 二核苷酸多发生甲基化。肿瘤中, 常伴随基因组整体甲基化水平降低和某些基因 CpG 岛区域甲基化水平异常升高(如抑癌基 因),而且这2 种变化可以在一种肿瘤中同时发生(见图 1)。基因组整体甲基化水平降低, 可导致原癌基因活化、转座子的异常表达、基因组不稳定等,这些因素促进了肿瘤的发生; 基因启动子区的 CpG 岛发生异常高甲基化,可导致基因转录沉默,使重要基因如抑癌基因、 细胞周期调节基因、凋亡基因等表达极度降低或不表达, 进而也促进了肿瘤细胞的形成(见 图 1)。 图1 肿瘤细胞中的DNA 甲基化异常 (2 )组蛋白修饰与肿瘤发生 DNA 以染色质的形式存在于细胞核中,染色质通常由DNA 、组蛋白、非组蛋白以及少 量 RNA 包装而成,而组蛋白是染色质的基本结构蛋白。组蛋白的 N2 末端可以发生多种共 价修饰作用,其中乙酰化最为重要。通常认为,组蛋白氨基末端赖氨酸残基的高乙酰化与染 色质松散及基因转录激活有关,而低乙酰化与基因沉默或抑制有关。 (3 )染色质重塑与肿瘤的发生 染色体重塑是指染色质位置和结构的变化,主要涉及在能量驱动下核小体的置换或重新 排列,它改变了核小体在基因启动子区的排列,增加了基因转录装置和启动子的可接近性。 染色质重塑的发生和组蛋白 N 端尾巴修饰密切相关,尤其是对组蛋白 H3 和 H4 的修饰。 修饰直接影响核小体的结构,并为其他蛋白提供了和 DNA 作用的结合位点。染色质重塑主 要包括 2 种类型: 一类是含有组蛋白乙酰转移酶和脱乙酰酶的化学修饰;另一类是依赖 ATP 的物理修饰,利用ATP 水解释放的能量解开组蛋白和 DNA 的结合,使转录得以进行。 染色质重塑属于表观遗传学的范畴,主要参与基因转录的调控,并与细胞凋亡、DNA 损伤修复、细胞增殖分化、维持基因组稳定性等方面相关。调控染色质重塑的机制主要有组 蛋白修饰、ATP 酶依赖的染色质重塑、DNA 甲基化、RNA 调控等。染色质重塑异常与肿瘤 的发生有重要关系,针对染色质重塑异常已经研发出多种 HDAC 抑制剂和低甲基化药物治 疗,取得一定疗效。 (4 )非编码RNA 与肿瘤: 真核生物转录产生了大量的非编码 RNA(ncRNA) ,种类繁多﹑表达及调节模式复杂多 样,且对细胞的生长是必须的,并非是转录的垃圾。目前在功能性 ncRNA 领域中研究较 多 的 是 小 分 子 RNA, 主 要 有 小 干 扰 RNA(small interfering RNA,siRNA) 和 微 小 RNA(microRNA ,miRNA)等。ncRNA 在遗传信息的载体(DNA 和染色质)与表达产物(蛋白 质) 的相关生物过程中都有着极其重要的作用。非编码RNA 既可作为癌基因,也可作为抑癌 基因,对肿瘤的发生、发展产生重大的影响。同时,非编码 RNA 又有希望成为肿瘤诊断的 标志物和肿瘤治疗的新靶点。 近年分子肿瘤学研究显示,lncRNA 与其他表观遗传形式相互作用,如 lncRNA 可通过 多种途径调控 DNA 甲基化、组蛋白修饰、染色质重构和其他RNA 干
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