复杂疾病的遗传分析.pdfVIP

HEREDITAS (Beijing) 2008 年5 月, 30(5): 543―549 ISSN 0253-9772 综 述 DOI: 10.3724/SP.J.1005.2008.00543 复杂疾病全基因组关联研究进展——遗传统计分析 严卫丽 新疆医科大学公共卫生学院, 乌鲁木齐 830054 摘要: 2005 年, Science 杂志首次报道了有关人类年龄相关性黄斑变性的全基因组关联研究, 此后有关肥胖、2 型糖尿病、冠心病、阿尔茨海默病等一系列复杂疾病的全基因组关联研究被陆续报道, 这一阶段被称为人类全 基因组关联研究的第一次浪潮。文章分别介绍了全基因组关联研究统计分析的方法、软件和应用实例; 比较了 关联分析中多重检验的P 值调整方法, 包括 Bonferroni 、递减的Bonferroni 校正法、模拟运算法和控制错误发 现率的方法; 还讨论了人群混杂对关联分析结果可能产生的影响及原理, 以及全基因组关联研究中控制人群混 杂的方法的研究进展和应用实例。在全基因组关联研究的第一次浪潮中, 应用经典的遗传统计方法发现了许多 基因-表型之间的关联并且能够对这些关联做出解释, 其中包括许多基因组中的未知基因和染色体区域。然而, 全基因组关联研究的继续发展需要进一步阐述基因组内基因之间相互作用、基因-基因之间的复杂作用网络与 环境因素的相互作用在复杂疾病发生中的作用, 现有的统计分析方法肯定不能满足需要, 开发更为高级的统计 分析方法势在必行。最后, 文章还给出了全基因组关联研究统计分析软件的相关网站信息。 关键词: 全基因组关联研究; 检验效能; 多重检验校正; 人群混杂; 重复 Genome-wide association study on complex diseases: genetic statis- tical issues YAN Wei-Li School of Public Health, Xinjiang Medical University , Urumqi 830054, China Abstract: Since the first genome-wide association study on human age-related macular degeneration was reported by Sci- ence journal in 2005, a series of genome-wide association studies have been published on human complex diseases or traits, such as obesity, type 2 diabetes, coronary artery disease, Alzheimer’s disease and so on. The study of human genetics has recently undergone a dramatic transition which is called “the first wave of genome-wide association study”. Some issues in statistical analysis of genome-wide association studies were reviewed by this paper. First, statistical analysis guidelines,