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分子遗传学上海生命科学研究院考研——专业课复习笔记
基 础 知 识 篇
分 子 遗 传 学
▓☉ 除了少数RNA病毒外,DNA几乎是所有生物遗传信息的携带者。
▓☉ DNA分子携带了蛋白质氨基酸组成的信息和基因选择表达的信息。
▓☉ 与生物学和基因表达有关的大部分信息存在于长程力所引起的低频振动,使DNA的各部分序列间进行长距离对话。
▓☉ RNA碱解先得一2’、3’环式核苷酸中间产物,由于五元环稳定性差,很快变成2’核苷酸、3’核苷酸的混合物。
▓☉ 碱基平面与螺旋基本上是垂直的,嘌呤环、嘧啶环上的氨基和酮基是亲水的,因而配对碱基间能形成氢键,嘌呤环、嘧啶环本身是疏水的,因而同一条链中的相邻碱基能形成一种堆积力。
▓☉ 双螺旋中任一条链绕轴一周所升降的距离叫螺距。
▓☉ Marmur-Dofy关系式:G+C%在30%-70%内,在0.15M NaCl+0.015M 柠檬酸钠溶液中,Tm值为:Tm=69.3+0.41(G+C)%
▓☉ 尿素、甲酰胺由于减少了氢键形成的机会,Tm值降低。
▓☉ 氢键有高度的方向性,供体原子、氢原子、受体原子处于同一条直线上时,氢键最强。
▓☉ 多聚寡核苷酸倾向于有一个三维结构以使高度溶解的磷酸基团与水保持最大的接触,而把碱基与水的接触减少到最低程度。
▓☉ 无规线团:一高聚物的长链上,无任何链内的相互作用,每一单体可以对于相邻的单体自由旋转,其限制仅是两个原子不能占据同一空间。
▓☉ 双链DNA中的碱基比单链DNA中碱基的堆积程度高,是由两条链配对碱基间的氢键引起的。所有的碱基都指向正确方向时,达到最大的氢键键合。已经被堆积的碱基更容易键合,已经被氢键定向的的碱基更容易堆积。
▓☉ 从嘌呤到嘧啶方向的碱基堆积作用大于从嘧啶到嘌呤方向的碱基堆积作用。
▓☉ 呼吸作用:生理状态下,双螺旋碱基对间的氢键不断地断裂、再生。
▓☉ 在双链DNA的两端,有3——7个碱基对不同程度的处于单链状态。这种现象叫绽裂。(fraying)
▓☉ 大多数原核生物都是共价封闭环,CCC分子。它再螺旋化为超螺旋分子。超螺旋是有方向性的,有正超螺旋和负超螺旋两种。
▓☉ 超螺旋密度(链环数比差):δ=τ/α°=(α-α°)/α°。每圈初级螺旋的超螺旋数。大多数生物的这一数值为—0..05。11.5时,DNA的一级结构几乎无任何变化,而RNA;链在几分钟内降解为2’- 单核苷酸、3’--单核苷酸。RNA碱水解先形成2’3’—环式单核苷酸中间产物,后转变为2’- 单核苷酸、3’--单核苷酸混合物。
▓☉ 酶法测序中,从凝胶的放射子显影X-胶片上读出的序列是互补链的序列。这种方法叫间接拷贝法。
▓☉ 决定DNA双螺旋结构状态的因素中,互补的碱基结合力、碱基堆积力利于DAN维持双螺旋结构。磷酸基的静电斥力、碱基分子内能不利于DAN维持双螺旋结构。
▓☉ 浓度都为50μg/ml时,双螺旋DNA的A260为1.00;完全变性的单链DNA的A260为1.37;单核苷的等比例混合物的A260为1.60。由于DNA变性引起的光吸收增加称增色效应。
▓☉ 要维持DNA的单链状态,或者是PH11.3,或者是使盐浓度低于0.01Mol/L。 DNA复性是一种双分子的二级反应,单链的消失速度为-dC/dt=KC2。K为二级反应常数。单位为升/摩秒。它取决于阳离子浓度、温度、片段大小、DNA分子序列的复杂性。
▓☉ B构象的条件为:生理盐浓度92%相对湿度。A构象的条件为:Na+、K+/Cs+作为反离子,75%相对湿度。C构象的条件为:Li+作为反离子,66%相对湿度。DNA-RNA、RNA-RNA双链均采用A构象。
▓☉ 沟的深浅取决于螺旋轴的位置,而沟的宽窄主要决定于两个糖苷键与碱基对的相对位置的糖苷键的顺反构象。
▓☉ 在B、A等右手双螺旋构型中,糖苷键均为反式构象。而Z-DNA中嘧啶糖苷键仍为反式构象,而嘌呤糖苷键为顺式构象。
▓☉ 翻板假说:B向Z的转变中,鸟嘌呤绕糖苷键,由反式变为顺式,而胞嘧啶连同核糖一起翻了个身。
▓☉ A-DNA、B-DNA、Z-DNA不只是代表了单一构象,而是代表了一组相关构象,这一组相关构象称为构象家族。
▓☉ 螺旋桨扭转是一个碱基对中的两个碱基并不处于同一平面中,是两个碱基的长轴各自向着相反的方向扭转。如果沿碱基的长轴看去,最近的一个碱基总是顺时针方向扭转。螺旋桨扭转总定
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