三穗鸭Bmal1基因多态、表达差异与生物信息学分析.pdfVIP

三穗鸭Bmall基因多态、表达差异 与生物信息学分析 陆曼1,2,3王旭平1’2一，李博岩1，柳诚刚“2一，李潇蒙1’2一，杨胜林h2，” (1．贵州大学动物科学学院，贵州贵阳550025； 2．高原山地动物遗传育种与繁殖省部共建教育部重点实验室，贵州贵阳550025； 3．贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室，贵州贵阳550025) 摘要：通过研究贵州三穗鸭损伤表皮调节因子(Bmall)基因的多态性，寻找其SNP多态位 点及分析其在组织中的表达差异。利用PCR—SSCP技术与直接测序技术相结合和荧光定量表达 的方法对Bmall基因进行SNPs位点筛选和遗传特性分析，根据测序结果拼接获得的序列对该基 因mRNA相关生物信息学进行分析。贵州三穗鸭Bmall基因第一外显子存在两处SNP位点，且 在脑组织中的表达量最高，2。A姗值为1．4431。Bmall基因突变前后的等位基因频率估算有差异， 但其mRNA二级结构预测，蛋白质二、三级结构预测分析均无差异。在心、肝、肾、胸肌、腿肌、脑、 眼七个组织中表达存在差异，且各组间差异显著。 关键词：三穗鸭；Bmall基因；SNPs；表达差异；生物信息学 中图分类号：$834．2 文献标识码：A 文章编号：1004—6364(2017)06—11—06 onSNP andBioinformatics Analysis Screening，Expression ofBmallGeneinSansuiDuck LUManl,2,3WANG Xupin91，2…，LIBoyanl，2一，LIUChenggangl,2,3,LIXiaomen91,2,3,YANGShenglinl2，p ofAnimal Science，Guizhou 550025； (1．College University，Guiyang，Guizhou ofAnimal and inthe 2．KeyLaboratory Genetics．BreedingReproduction PlateauMountainous of 550025； Region，MinistryEducation，Guiyang，Guizhou ofAnimal and in 3．Key Genetics，BreedingReproduction Laboratory Guizhou 550025) Province，Guiyang，Guizhou orderto the ofBmall itsSNP sitesand its Abstract：In study polymorphismsgene，find polymorphic analyze indifferenttissuesofGuizhouSansuiduck，PCR—SSCP expression technique，directsequencing andSPSS19．0softwarewerecombinedtoselecttheSNPlociofBmall inSansui its technology