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第八讲蛋白质的1-4级结构
N C N 反平行式 蚕丝心蛋白 ?-回折(或发夹结构) 在?-转角部分,由四个氨基酸残基组成;弯曲处的第一个氨基酸残基的 -C=O 和第四个残基的 –N-H 之间形成氢键,形成一个不很稳定的环状结构。 其特点是肽链回折180度 Gly3和Pro2 3. ?-转角 ★目前发现的?-转角多数都存在蛋白质分子表面,它们的含量相当丰富,约占全部AA残基的1/4。 4.无规卷曲或自由回转 肽段在空间的不规则排布称为无规则卷曲。 在一般球蛋白分子中,往往含有大量的无规则卷曲,它使蛋白质肽链从整体上形成球状构象。 无规则卷曲示意图 细胞色素C的三级结构 无规则卷曲 1.超二级结构指蛋白质中相邻的二级结构单位(?-螺旋或?-折叠或?-转角)组合在一起,形成有规则的、在空间上能够辨认的二级结构组合体。 2.超二级结构的基本类型: ??、 ?X?、??? 一. 超二级结构 超二级结构类型 ? ? ?X? ????? ? ? ? 免疫球蛋白VL β -折叠结构域 又叫β -折叠桶 纤维状蛋白质可分为: 角蛋白 不溶性 胶原蛋白 弹性蛋白 可溶性 肌球蛋白 纤维蛋白原 纤维状蛋白 角蛋白 胶原蛋白 ?-角蛋白(头发) ?-角蛋白(丝心) 弹性蛋白 (1)角蛋白 角蛋白中主要的是?-角蛋白。 ?-角蛋白主要由?-螺旋构成的多肽链组成。一般是由三条右手?-螺旋肽链形成一个原纤维(向左缠绕),原纤维的肽链之间有二硫键交联以维持其稳定性 ?-角蛋白的伸缩性能很好,当?-角蛋白被过度拉伸时,则氢键被破坏而不能复原。此时?-角蛋白转变成?-折叠结构,称为?-角蛋白。 毛发的结构 一根毛发周围是一层鳞状细胞,中间为皮层细胞。皮层细胞横截面直径约为20?m。在这些细胞中,大纤维沿轴向排列。所以一根毛发具有高度有序的结构。 大纤维 微纤维 角质层 角蛋白分子中的二硫键 卷发(烫发)的生物化学基础 卷发(烫发)是一项生物化学工程 ?—角蛋白在湿热条件下可以伸展转变为?—构象,但在冷却干燥时又可自发地恢复原状。这是因为?—角蛋白的侧链R基一般都比较大,不适于处在?—构象状态; 此外?—角蛋白中的螺旋多肽链间有着很多的二硫键交联,这些交联键也是当外力解除后使肽链恢复原状(?—螺旋构象)的重要力量。这就是卷发行业的生化基础。 (2)?-角蛋白 丝心蛋白(fibroin):这是蚕丝和蜘蛛丝的一种蛋白质。丝心蛋白具有抗张强度高,质地柔软的特性,但不能拉伸。丝心蛋白是典型的反平行式?-折叠片,多肽链取锯齿状折叠构象。 定义:对于较大的蛋白质分子或亚基,多肽链往往由两个或两个以上相对独立的三维实体(超二级结构)缔合而成三级结构,这种相对独立的三维实体称结构域。 现在,结构域的概念有三种不同而又相互联系的涵义:即独立的结构单位、独立的功能单位和独立的折叠单位。 类型: α -螺旋域; β -折叠域; α+β域; α /β域;无规则卷曲+β-回折域; 无规则卷曲+ α -螺旋结构域 二. 结构域 结构域1 结构域2 ?-折叠 ?-转角 二硫键 ?-螺旋 卵溶菌酶的三级结构中的两个结构域 两个铁原子 蚯蚓血红蛋白中四个?-螺旋组成的结构域 α -螺旋域; 免疫球蛋白VL β -折叠结构域 β -折叠域; 丙酮酸激酶结构域4 α /β结构域 3-P-甘油醛脱氢酶结构域2 α+β结构域 木瓜蛋白酶结构域1 无规则卷曲+ α -螺旋结构域 木瓜蛋白酶结构域2 无规则卷曲+β-回折结构域 2.丹磺酰氯反应(DNS) + HCI 有荧光 丹磺酰氯是二甲氨基萘磺酰氯的简称 (DNS法)丹磺酰氯反应 -HCl + 氨基酸混合物 水解 多肽 多肽 DNS-氨基酸 具有荧光 + PITC 弱碱中 (400 C) 苯硫乙内酰脲(PTH-AA) (无水氢氟酸中) H+ 苯氨基硫甲酰氨基酸(PTC-氨基酸) 3.(Edman反应) Edman法(异硫氰酸苯脂反应) PITC 用层析法分离 酶解法:如胰蛋白酶 胰凝乳蛋白酶 化学法:如溴化氰法 羟胺法 ⑤ 裂解多肽链成较小的片段 胰蛋白酶 R1=Lys和Arg侧链(专一性较强,水解速度快)。 R2=Pro 水解受抑。 糜蛋白酶 或胰凝乳蛋白酶: R1=Phe, Trp,Tyr时水解快; R1= Leu,Met和His水解稍慢。 R2=Pro 水解受抑。 胃蛋白酶 R1和R2=Phe, Trp, Tyr; Leu以及其它疏水性氨基酸水解速度较快。 R1=Pro 水解受抑 嗜热菌蛋白酶 R2=Phe, Trp, Tyr; L
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