基于转录组信息的艾纳香牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶基因（BbGGPS）的克隆及序列分析.pdfVIP

山地农业生物学报　 35(4):0023~0029,2016 Journal of Mountain Agriculture and Biology 基于转录组信息的艾纳香牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸 合成酶基因(BbGGPS) 的克隆及序列分析 1 2∗ 2 3 3 夏奇峰 ,赵　 致 ,刘红昌 ,官玲亮 ,庞玉新 (1.贵州大学 生命科学学院,贵州 贵阳550025;2.贵州大学农学院贵州省中药材重点实验室, 贵州 贵阳550025;3.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所/ 农业部华南作物基因资源与 种质创制重点开放实验室/ 海南省艾纳香工程技术研究中心,海南 儋州 571737) - 摘　 要:采用RT PCR和RACE(Rapid amplification of cDNA ends)技术,从艾纳香(Blumea balsamifera L ·DC)的 叶片中克隆到二萜化合物合成的关键酶牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶(BbGGPS)基因。 结果显示:BbGGPS基 因的cDNA全长1475 bp,包含开放阅读框(ORF)1002 bp,编码334 个氨基酸;亚细胞结构定位于叶绿体,既非膜 蛋白也非分泌性蛋白。 疏水性分析显示,BbGGPS是亲水性蛋白。 同源性比对结果显示,BbGGPS蛋白与其他植物 中GGPS蛋白具有高度的相似性。 系统发育分析表明,所有序列被聚为5 大类,BbGGPS 与菊科植物刺菜蓟聚 (Cynara cardunculus var)为一类,表明与其亲缘关系最近。 关键词:艾纳香;牻牛儿基牻牛儿基焦磷酸合成酶;氨基酸序列;系统发育分析 中图分类号:Q756　 　 　 文献标识码:A - - - 文章编号:1008 0457(2016)04 0023 07　 　 　 　 　 　 国际DOI编码:10.15958/ ki.sdnyswxb.2016．04．005 Analysis of geranylgeranyl pyrophosphate synthase (GGPS) sequence of Blumea balsamifera (L.) ·DCbased on transcriptome information 1 2 ∗ 2 3 ∗ 3 - - - - XIA Qi feng ,ZHAOZhi ,LIUHong chang ,GUAN Ling liang ,PANG Yu xin (1. Guizhou University,Collegeof LifeSciences,Guiyang,Guizhou550025,China;2. Guizhou Univer- sity College of Agriculture,Guiyang,Guizhou550025,China;3. Tropical Crops GeneticResourcesInsti- tute,ChineseAcademy of TropicalAgricultural Sciences,Danzhou,Hainan 571737,China) Abstract:A geranylgeranyl diphosphate synthase gene,designatedBbGGPS,hasbeen isolatedfromBlumea balsamifera - (L.) DCusing reverse transcription polymerase chain reaction approach (