七种药用植物c4h基因密码子偏好性及聚类分析.pdfVIP

黑龙 江 农 业 科 学 ???????：?～?? ??????????????????????????????????? 七 种 药 用 植 物 ???基 因密 码 子 偏 好 性 及 聚类 分 析? 王 晖? ，高德 满?，高 妍夏?，李 学军。，马 博辉?，杨 贵 明? ??．承德 医学院 蚕 业研 究所 ，河 北省 高校 特 产蚕 桑应 用技 术研 发 中心 ，河北 承德 ??????；?．锡? 林 郭勒 盟 第二 中 学，内蒙古 锡 林 浩特 ??????；?．承 德 医学 院 中药研 究所 ，河 北 承 德 ??????；? ?．承 德 医学院 图书馆 ，河北 承 德 ???????? 摘 要 ：为 了深入 研 究 药 用植 物 基 因特 性 ，利 用 ?????? 和 ??????．?软 件 对 丹 参 、黄 芪 、黄 芩 、忍 冬 、桑 树 、野 甘? 草 、长春 花 共 ?种 药 用 植 物 ???基 因 密码 子进 行 偏 好 性 和 聚 类 分 析 。结 果 表 明 ：?种 药 用 植 物 ???基 因的 有 效? 密 码 子 数 介 于 ??．?～??．??，密码 子使 用偏 好 性 弱 ，?种 药 用 植 物 倾 向 于 ?? 结 尾 的 密码 子 ，?种 倾 向 于 ?? 结? 尾 的 密码 子 。?种 药 用植 物 经 聚 类 分 析 分 为 两 大 类 ，长春 花 与 黄 芪 为 一 大 类 ，另 一 大 类 中 ，丹 参 与 黄 芩 为 一? 类 ，野 甘 草 、桑树 和 忍 冬 为 一 类 。? 关 键 词 ：???基 因 ；密码 子偏 好性 ；聚类 分析? 中图分 类号 ：????．?? 文 献标 识码 ：? 文章 编 号 ：????—????????????—????—??? ????：??．??％?／?．????????—????．????．??．????? 肉 桂 酸 羟 化 酶 ???????????一???????????，? 表 ?? ?种 药 用 植 物 ???基 因 的 序 列 信 息? ????是 一 种 ????酶 ，是 苯 丙 烷 途 径 的 关 键 酶 ，? ???????? ???????????????????????????? 在 植物 生 长 、合成 多 种 次 生 代 谢 物 中起 着 重要 作? ???????????????? ???????????????? 用口?。我 国是药 用 植 物 大 国 ，目前 所 需 的许 多 化? 合 物 主要 从药 用 植 物 中直 接 提取 ，将 化 合 物 合 成? 相 关基 因克 隆到 表 达 系 统 中 ，用 于 产 生 所需 要 的? 化 合物 已成 为重要 的研 究方 向 。 目前美 日等 发 达? 国家在 这 方 面走 在 前 列 ，并 将 一 些 重 要 基 因 注 册? 专 利 ，我 国现 已完 成人 参及 丹参 等 的基 因组 测序 。? 由于药 用 植物 种 类 多 、基 因组 测 序 费 用 昂 贵 等 因? 素 制 约 了药用 植物 基 因 的研 究 ，针对 这 种现 状 ，应? 选 择用 量 大 且 药效 显 著 的 药 用 植 物 进 行 重 点 研? 究 。由于 不 同的生 物 物种或 同一