10 微生物的分类鉴定.pptVIP

生物种数：150万种 微生物种数：15万～20万种 微生物分类学 是一门按微生物的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（taxon）的科学。 分类学的具体任务：分类（classification）、鉴定（identification）和命名（ nomenclature ）。 第一节 通用分类单元及命名 1.1 种以上的系统分类单元 1.1.1 七级分类单元 　　界Kingdom（Regnum） 　　 门Phylum（phylum） 　 纲Class（Classis） 　　　 目Order（Ordo） 　　 科Family（Familia） 　　　　 属Gennus（Genus） 　　　　　　 种Species（Species） 1.1.2 种（species）的概念 概念：是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内其他物种有着明显差异的一大群菌株的总称。 种是一个基本分类单位。 典型菌株（type strain）→模式种（type species） 新种（species nova，sp. nov或nov sp.）：权威性的分类、鉴定手册种从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。后加“sp.nov”符号。 1.2 学名（Scientific name） 　 　　各种微生物均有各自的名称（正名而非俗名）。 　　　　　　　　　　　　　　　　　　 　　　　　　　 1.2.1 双名法 学名＝属名＋种名加词 1.2.2 三名法 学名＝属名＋种名加词+(符号subsp或var）+亚种或变种的加词 1.2.3 有关学名的其他知识　　　 属名：属名词词首大写，表示种的主要特征；文中首次使用属名时不能缩写，重复出现的可用词首大写的一或几字母加点表示，如Bacillus可缩写为B. 或Bac. 种名加词：种名词首小写，表次种的次要特征；使用时写出属名及种名未定时用sp.（一种）或spp.（几种）代替。 学名的发音：按规定应按拉丁发音规则，实际以英文发音居多。 第二节　微生物分类鉴定的方法 微生物鉴定的工作步骤 1. 获取纯培养物（pure culture） 2. 测定各鉴定指标：各大类有各自重点指标 真菌以形态为主 酵母和放线菌则以形态与生理兼用 细菌较多使用生理指标 3. 查找权威性鉴定手册 分类鉴定技术四个水平：细胞形态和习性水平， 细胞组分水平，蛋白质水平，基因或DNA水平（核酸水平） 2.1 微生物分类鉴定中的经典方法 2.1.2 微生物的微型、简便、快速或自动化鉴定技术 API细菌数值鉴定系统（API系统） “Enterotube”系统 “Biolog”全自动和手动细菌鉴定系统 2.2 微生物分类鉴定中的现代方法 2.2.1 通过核酸分析鉴定微生物遗传型 Ⅰ. DNA碱基比例的测定（G+C）mol％ ①亲缘关系相近，其 GC比接近；GC比接近，其亲缘关系不一定接近。 ② GC比差距很大的微生物，其亲缘关系必定较远 ③ GC比是建立新分类单元时的可靠指标。 GC比相差小于2％，无分类学上的意义 GC比差别在2.5％～4.0％之间，为种内各菌株 GC比差别大于5％，不属于同种 GC比差别大于10％，不属于同属 Ⅱ. 核酸分子杂交法（hybridization of nucleic acids） Ⅲ. rRNA寡核苷酸编目（oligonucleotide catalog）分析 一种通过分析原核或真核细胞中最稳定的rRNA寡核苷酸序列同源性程度，以确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法。 Ⅳ. 微生物全基因组序列的测定 2.2.2 细胞化学成分用作鉴定指标 Ⅰ. 细胞壁的化学成分 原核生物细胞壁成分的分析。 Ⅱ. 全细胞水解液的糖型 放线菌全细胞水解液糖型的分析。 2.2.3 数值分类法（numerical taxonomy） 又称统计分类法或电子计算机分类法，是一种依据数值分析的原理，借助现代计算机技术对拟分类的微生物对象按大量表型性状的相似性程度进行统计、归类的方法。 分类工作的基本步骤 计算两菌株间的相关系数 列出相似度矩阵 将矩阵图转换成树状谱 第十章 微生物的分类鉴定 命名(nomenclature)：是根据命名法规，给每一个分类群一个专有的名称； 鉴定(identification或determination)：借助于现有的微生物分类系统，通过特征测定，确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 分类(classificat