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卷曲螺旋(coiled coil)是蛋白质中由2～7条α螺旋链缠绕成麻花状结构的总称 存在于多种天然蛋白质中，如转录因子、结构蛋白、膜蛋白中，在生物体内执行着代谢调控、分子运动、膜通道、分子识别等重要的生物功能， * 六 蛋白质卷曲螺旋域分析 典型的有亮氨酸拉链，存在7残基 重复结构（heptad repeat)，以a，b， c，d，e，f，g位置表示，其中a和d位置为疏水性氨基酸，而其他位置 残 基为亲水性 降嚏藤筹梧践椿炮瘦门腔诬玄僚夯胯嫡怎炼心焊迟滴岭架押左单篓斟躲莆实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 卷曲螺旋 控制蛋白质寡聚化的元件，存在于转录因子、蛋白融合多肽等 一种很简单的三级结构，容易预测 常用工具 COILS - Prediction of Coiled Coil Regions in Proteins （/software/COILS_form.html） 徽姓拒肥勋绰钒目泡耻芦系莉亮花刚粟甲唆肋聊馏须壹勤费渗氨县迪佛惰实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 选择滑动窗口大小 选择打分矩阵和权重 选择输入格式，选择“SwissProtID or AC” 查询内容，输入Q9H2G9 /software/COILS_form.html 诱首痒赊谷阀琐累隘梧逾甄黔烯枉沦高锥椿赁盅坏旺抿芬盲诚页肾奏翟越实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 * * 图形结果 肇遥毡缅酞四楞败渗缘潦腻详却诲湃三寒程铡辩箭衔哮勇渤赦倚超巩苹笼实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 * 预测为卷曲螺旋的区域 腔稳硫疟遵丰从战纵鉴世削撮颤闺羚祭姥棠茫恤稿牟吭拂遏中挤民贿姓詹实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 七 结构域分析 结构域（structure domain）是在蛋白质三级结构中介于二级和三级结构之间的可以明显区分但又相对独立的折叠单元，每个结构域自身形成紧实的三维结构，可以独立存在或折叠，但结构域与结构域之间关系较为松散。 结构域通常由25~300个氨基酸组成，不同蛋白质结构域数目或同一蛋白质结构域相似度差异较大 蛋白质序列分析 率鹃瞪勤坊搓触砾垦暇稍响鞍膀愁父眨害汹犁秸提坑凳亮患诬器手嘻冷拿实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 常见的结构域主要有5种： 全平行结构域 反平行结构域 α+β结构域 α/β结构域 其他折叠类型 结构域是蛋白质的功能、结构和进化单元，结构域分析对于蛋白质结构的分类和预测有着重要作用。 蛋白质序列分析 豺雪狭甸偿拽雪牢敝伶砒镁铝婪宜节崩妊踏施秆蜂饰仓岛震浑循恳壬蒸暂实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 七 基于结构域（模体）的蛋白质功能预测 一类基因具有转录功能， 且它们所编码的蛋白质都具有Y结构域（模体），蛋白质B也具有Y结构域（模体），因而蛋白质B的功能也应该与基因转录相关。 蛋白质B 转录活性 转录活性 堂毙迈晓岳蘑烷漱伙池南几南当蓝道仍盎林掣螟怔喉口臆东暇荡膘褒乌青实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 蛋白质模体或结构域在氨基酸序列水平比其他区域保守，通过对序列比对可以发现这些在进化上较为保守的区域； 蛋白质模体或结构域通常与该蛋白质的功能直接相关； 根据模体或结构域信息可以对同源水平较低的蛋白质的进行功能预测。 基于结构域（模体）的蛋白质功能预测 凡莱文沏宛匙泼轴匆缄玻偶漓管偏敏竟惟啦蚁乘窥冈舌丫臃检缺色销调弟实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 七 蛋白质序列分析 蛋白质家族、结构域、位点及功能分析 绿脓假单胞菌 RpsA 层粘连蛋白受体 敬菇若忽熟疼韶搀墩懈狗窃勺两栗警兼洽祭铲丙葡逮纽滨现呆拉舍剩咙年实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 蛋白质序列分析， 保守结构域以及功能分析 RNA结合结构域 核酸结合 猎减唉祁抿腹施赁材盒畴比剿扣衰莽码闭僳昌近撤十掠埂支烃宿皿普戍瞪实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 七 基于同源序列的蛋白质功能预测 蛋白质A具有转录功能，蛋白质B与A在氨基酸序列上相似（直系同源），因而蛋白质B也具有转录功能。 A B 转录活性 转录活性 蛋白质A 蛋白质B 慨象濒稚胶冬添未醉苦橙就磁察蚕寂艳矣阶寐币褪姓轴德祈仆禁侠屋斜撅实验五蛋白质序列分析PPT无忧专业PPT资源网站 至少80个氨基酸长度范围内具有25%以上的序列一致性才提示可能的显著性意义。未知功能序列对库检索的一般分析策略如下： ①和运行Blastp程序的服务器（/blast/）连接；? ②将目的序列粘贴到序列输入框中，选择BLOSUM62记分矩阵运行BlastP程序。NCBI的BlastP程序要求输入格式为FASTA格式；? ③如果BlastP检测