浙大生物統计实验报告1.docxVIP

课程名称：生物统计与实验设计姓 名：赵应学 院：农业与生物技术学院系：应用生物科学专 业：应用生物科学学 号：3140100080指导教师：朱军、徐海明2016年4 月11 日专业： 应用生物科学 姓名： 赵应 学号： 3140100080 日期： 2016年4月11日 地点：紫金港西1-106（多） 装 订 线实验报告课程名称： 生物统计与实验设计 指导老师： 徐海明 成绩：_____________ ___实验名称： 简单统计分析和简单线性回归 实验类型： 综合实验 同组学生姓名： 无 实验目的和要求初步了解Excel软件的数据分析功能，掌握连续变量和离散变量的样本资料简单统计分析的方法，掌握简单回归模型的分析方法。实验内容和原理1、连续变量的统计分析方法；2、离散变量的分析方法；3、简单回归模型的统计分析方法。主要仪器设备一台装有excel和SAS软件的PC操作方法和实验步骤实验数据的生成：本实验所用的数据需要基于设置的参数，运行计算机模拟软件(QTLSimulation.exe)产生。先打开参数设置文件SimPar.txt，用自己的学号替换第一设置行“The seed for initilizing the rand() = 2551949”中的随机数发生器的种子“2551949”。然后重新保存设置文件。运行模拟软件时需要输入参数设置文件名。模拟软件产生三个文件，DHSim.Par是基因数目、位置、效应的参数文件，DHSim.Map是分子标记遗传图谱的文件，DHSim.Txt是基因定位遗传群体（样本数n =200）的分子标记和二个环境模拟性状的表现型值的文件。以DHSimuData.xls文件的格式，整理可分析的数据文件。计算机模拟的参数设置如下：表 1 参数设置QTLChromosomeMarkerIntervalDistance(cM)AAE1AE21133.04.704.47-4.472178.00.000.000.003245.0-4.100.000.004362.00.000.000.005331.03.50-3.163.16表 2 参数设置InteractionQTL-iQTL-jAAAAE1AAE21123.200.000.002130.00-4.204.20324-3.003.16-3.16实验数据的分析：采用Excel软件整理数据，采用Excel对样本资料进行简单的统计分析和简单回归分析，如下：连续变量的统计分析：采用Excel分别计算仿真群体的表现型数据的样本均值、样本方差、标准误。离散变量的统计分析 ：对各分子标记位点，采用Excel计算仿真群体的分子标记基因型频率、样本频率的方差、标准误。简单回归模型的统计分析方法;采用Excel以环境一的数据为依变量，以环境二的数据为自变量，计算简单线性回归系数的估计值及其标准误、计算各项变异的自由度、平方和、均方。采用Excel分别以二个环境的表现型数据为依变量，分子标记为自变量，计算仿真群体表现型数据与分子标记的简单相关系数。实验数据记录和处理表 3 连续变量的统计分析表现型方差表现型标准差表现型标准误环境1173.143597713.158404070.930439675环境294.651161719.728882860.687935904均值95%下限均值95%上限方差95%下限方差95%上限环境1102.2243844105.893957614391719环境296.8322499.545407839390表 4 离散变量的统计分析均值方差标准误A的频率0.4939390.000340.003211B的频率0.5060610.000340.003211以环境一的表现型值为依变量，以环境二的表现型值为自变量，运行sas程序，得到：表 5 仿真群体表现型数据与分子标记的简单相关系数Mk1Mk2Mk3Mk4Mk5Mk6Mk7Mk8Mk9环境1-0.40929-0.51972-0.67318-0.616-0.53924-0.40714-0.35012-0.29228-0.27644环境2-0.06068-0.0452-0.015160.0764560.1130360.0799870.0450660.045995-0.02191Mk10Mk11Mk12Mk13Mk14Mk15Mk16Mk17Mk18环境1-0.19791-0.200390.1902740.194260.2731340.3249830.2727910.2170110.188191环境2-0.05579-0.075730.2174890.2539640.2903370.3997820.3680530.257015