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信息传递及信号转导和血液与肝的生化.
DNA的生物合成
DNA复制的酶:DNA-pol(依赖DNA的DNA聚合酶/DDDP)。原料为dNTP。
原核生物DNA聚合酶:
DNA-pol Ⅰ 小片段:有5——3核酸外切酶活性 校读、修复、填补缺口 大片段(Klenow片段):有5——3聚合酶活性和3——5核酸外切酶活性 DNA-pol Ⅱ 有5——3聚合酶活性,参与应激状态修复 DNA-pol Ⅲ 真正起催化作用,有5——3聚合酶活性和3——5核酸外切酶活性
真核生物DNA聚合酶:
DNA-pol α 起始引发,引物酶活性 DNA-pol β 低保真度的复制 DNA-pol γ 线粒体DNA复制 DNA-pol δ 起主要催化作用,类似于DNA-pol Ⅲ;还有解螺旋酶活性 DNA-pol ε 校读、修复、填补缺口,类似于DNA-pol Ⅰ
DNA复制时需要的酶:DnaA(起始点辨认)、DnaB(解螺旋酶)、DnaC(是DnaB的助手)、DnaG(引物酶,催化RNA引物生成)、SSB(单链DNA结合蛋白,稳定已解开的DNA单链)、拓扑异构酶(DNA解螺旋时起理顺作用,断开→连接)。
DNA连接酶需要ATP供能。
拓扑异构酶对DNA分子的作用:解开DNA超螺旋,切断单链DNA,连接3——5磷酸二酯键,改变DNA分子的拓扑构象,理顺DNA链。
引发体组成:DnaB、DnaC、DnaG和DNA的起始复制区域。
冈崎片段的处理(DNA复制过程中的切除修复):水解(RNA酶)、填补(DNA-pol Ⅰ催化)、连接(DNA连接酶)。
DNA损伤的切除修复:内切酶、外切酶、连接酶、聚合酶。
原核生物DNA复制起始点是oriC,起始点长度长,终止点是ter。
真核生物DNA复制起始点有很多,起始点长度短,可能有蛋白质--DNA复合物参与。终止点为端粒。
端粒富含GT小段(GGGGTTTTGGGGTTTT),可维持染色体的稳定性和DNA复制的完整性。
端粒酶:由RNA和蛋白质组成,是一种特殊的逆转录酶。
紫外线对DNA的损伤主要是形成嘧啶二聚体。修复时需要光修复酶(UvraA、UvraB),DNA-pol Ⅰ,DNA连接酶,解螺旋酶。
镰形红细胞贫血:点突变(T→A)
地中海贫血:基因重排
着色性干皮病:与DNA修复有缺陷有关
RNA的生物合成
RNA不对称转录的酶:RNA-pol。原料为NTP、Mg2+、Mn2+。
结构基因:能转录出RNA的DNA区段。
全酶:α2ββσ,转录起始辨认起始点(σ亚基的功能)。
核心酶:α2ββ,转录延长阶段只需核心酶。
原核生物RNA合成:
RNA-pol 没有校对功能,缺乏3→5外切酶活性 α2 决定哪些基因被转录(因为有2个α。所以可以商量着决定基因转录) β 与NTP结合,形成磷酸二酯键(有两个洞,形象记忆为二酯键) β 与DNA模板结合,开链(β加个小钥匙,用来开链) σ σ的辨认起始点(圆圈的尾巴向上,为起始点,终止点为ρ,圆圈的尾巴向下
真核生物RNA合成:
RNA-pol Ⅰ 定位核仁,转录45S-rRNA (个头最大) RNA-pol Ⅱ 定位核浆,转录产生hnRNA→mRNA (最有用) RNA-pol Ⅲ 定位核浆,转录产生tRNA、5S-rRNA、snRNA (细胞中数量最少,个头最大)
利福平能专一性地结合RNA-pol的β亚基,抑制结核杆菌的转录。
对鹅膏蕈碱的敏感性:RNA-pol Ⅱ>RNA-pol Ⅲ>RNA-pol Ⅰ
操纵子:包括若干个结构基因及其上游的调控序列。
调控序列中含有启动子,启动子是RNA-pol结合DNA的部位,包括-10区(Pribnow盒,TATAAT序列)、-35区(TTGACA序列,是σ因子识别部位)等。
原核生物的mRNA不需修饰。
真核生物转录起始需要启动子、RNA-pol和转录因子(TF)的参与。
顺式作用元件包括:启动子、启动子上游原件、增强子等。
启动子:核心序列为TATA,称为TATA盒或Hognest盒。
启动子上游原件:是TATA盒上游的DNA序列,常见的是GC盒和CAAT盒。
反式作用元件包括:转录因子(TF)和上游因子。
转录因子:直接或间接结合RNA-pol。
上游因子:结合上游原件。如Sp1结合GC盒,C/EBP结合CAAT盒。
转录起始复合物(PIC)包括:TBP(TFⅡD+TATA盒),TFⅡB,TFⅡA,RNA-pol Ⅱ-TFⅡF复合体,TFⅡE,TFⅡH,DNA。TFⅡA形似三角形,起稳定作用,B是两个人促进结合,B中间的隔阂没了变成D是结合了,E有ATPase的作用,去掉底下的支撑后变成F就是解螺旋了。
转录终止修饰点为AATAAA序列和很多的GT序列。
蛋白质的生物合成
遗传密码
起始密码 AUG
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