生物化学：第一章 蛋白质化学课件.ppt

1.2 蛋白质中常见氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 1.3 氨基酸的分类 （一）根据来源分：内源氨基酸和外源氨基酸 （二）根据分子组成：脂肪族、芳香族、杂环氨基酸等 （三）根据R的极性分：极性和非极性氨基酸根据 （四）从营养学角度分：必需氨基酸和非必需氨 基酸 （五）是否组成蛋白质来分：蛋白质中常见 氨基酸、蛋白质中稀有氨基酸和非蛋白氨基酸 在少数蛋白质中分离出一些不常见的氨基酸，通常称为不常见蛋白质氨基酸。这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的。 广泛存在于各种细胞和组织中，呈游离或结合态，但并不存在蛋白质中的一类氨基酸，大部分也是蛋白质氨基酸的衍生物。 H2N-CH2-CH2-COOH H2N-CH2-CH2-CH2-COOH a. 作为细菌细胞壁中肽聚糖的组分：D-Glu D-Ala b.作为一些重要代谢物的前体或中间体:?-丙氨酸（VB3）、鸟氨酸（Orn）、胍氨酸（Cit）(尿素) c.作为神经传导的化学物质：?-氨基丁酸 d.有些氨基酸只作为一种N素的转运和贮藏载体 （刀豆氨酸） e.调节生长作用 f.杀虫防御作用 绝大部分非蛋白氨基酸的功能不清楚。 肽的重要理化性质 a. 肽晶体的熔点都很高。 b. 肽的酸碱性质主要来自游离末端?-NH2和游离末端?-COOH以及侧链上可解离的基团。 c. 每一种肽都有其相应的等电点. d. 肽也能发生茚三酮反应、 Sanger反应、DNS反应和Edman反应；还可发生双缩脲反应。 在生物体中，多肽最重要的存在形式是作为蛋白质的亚单位。 也有许多分子量比较小的多肽以游离状态存在。这类多肽通常都具有特殊的生理功能，常称为活性肽（active peptide）。 如：脑啡肽；激素类多肽；抗生素类多肽；谷胱甘肽；蛇毒多肽等。 ? L-Leu-D-Phe-L-Pro-L-Val ? ? L-Orn L-Orn ? ? L-Val-L-Pro-D-Phe-L-Leu ? 短杆菌肽S(环十肽) ? 由细菌分泌的多肽，有时也都含有D-氨基酸和一些非蛋白氨基酸。如鸟氨酸（Ornithine, 缩写为 Orn）。 定义—— 1969年，国际纯化学与应用化学委员会（IUPAC） 规定：蛋白质的一级结构指蛋白质多肽连中AA的排列顺序，包括二硫键的位置。其中最重要的是多肽链的氨基酸顺序，它是蛋白质生物功能的基础。 ?-螺旋（?-helix ） 三级结构特征 纤维状蛋白质通常只含有一种二级结构，而球状蛋白质往往含有多种二级结构； 球状蛋白质具有明显的折叠层次：一级结构→二级结构→超二级结构、结构域→三级结构或亚基→四级结构； 球状蛋白质是紧密的球状或椭球状实体； 疏水性侧链埋藏于球体分子内，亲水性侧链则暴露于表面； 球状分子的表面有一个空穴（裂沟、凹槽或口袋），能结合配体，是蛋白质的活性部位； 由二级结构向三级结构转变的主要力量是疏水作用。 氢键  氢键(hydrogen bond)的形成常见于连接在一电负性很强的原子上的氢原子，与另一电负性很强的原子之间。 氢键在维系蛋白质的空间结构稳定上起着重要的作用。 氢键的键能较低(~12kJ/mol)，因而易被破坏。  疏水键 非极性物质在含水的极性环境中存在时，会产生一种相互聚集的力，这种力称为疏水键或疏水作用力。 蛋白质分子中的许多氨基酸残基侧链也是非极性的，这些非极性的基团在水中也可相互聚集，形成疏水键，如L